Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
KCNH2Q12809 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KCNH2Q12809 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KCNH2Q12809 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KCNH2Q12809 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KCNH2Q12809 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KCNH2Q12809 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KCNH2Q12809 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KCNH2Q12809 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KCNH2Q12809 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KCNH2Q12809 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KCNH2Q12809 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KCNH2Q12809 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KCNH2Q12809 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KCNH2Q12809 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KCNH2Q12809 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KCNH2Q12809 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KCNH2Q12809 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KCNH2Q12809 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KCNH2Q12809 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KCNH2Q12809 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
KCNH2Q12809 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KCNH2Q12809 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KCNH2Q12809 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
KCNH2Q12809 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
KCNH2Q12809 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KCNH2Q12809 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KCNH2Q12809 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KCNH2Q12809 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
KCNH2Q12809 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
KCNH2Q12809 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KCNH2Q12809 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KCNH2Q12809 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KCNH2Q12809 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KCNH2Q12809 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KCNH2Q12809 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KCNH2Q12809 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
KCNH2Q12809 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KCNH2Q12809 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
KCNH2Q12809 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KCNH2Q12809 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KCNH2Q12809 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KCNH2Q12809 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KCNH2Q12809 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KCNH2Q12809 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KCNH2Q12809 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KCNH2Q12809 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KCNH2Q12809 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KCNH2Q12809 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
KCNH2Q12809 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KCNH2Q12809 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KCNH2Q12809 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KCNH2Q12809 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KCNH2Q12809 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KCNH2Q12809 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KCNH2Q12809 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KCNH2Q12809 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KCNH2Q12809 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KCNH2Q12809 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
KCNH2Q12809 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KCNH2Q12809 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
KCNH2Q12809 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
KCNH2Q12809 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KCNH2Q12809 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KCNH2Q12809 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KCNH2Q12809 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KCNH2Q12809 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KCNH2Q12809 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KCNH2Q12809 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KCNH2Q12809 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KCNH2Q12809 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KCNH2Q12809 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KCNH2Q12809 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KCNH2Q12809 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
KCNH2Q12809 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KCNH2Q12809 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KCNH2Q12809 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KCNH2Q12809 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KCNH2Q12809 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KCNH2Q12809 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KCNH2Q12809 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KCNH2Q12809 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KCNH2Q12809 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KCNH2Q12809 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KCNH2Q12809 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KCNH2Q12809 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KCNH2Q12809 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KCNH2Q12809 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KCNH2Q12809 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KCNH2Q12809 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
KCNH2Q12809 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KCNH2Q12809 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KCNH2Q12809 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KCNH2Q12809 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KCNH2Q12809 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KCNH2Q12809 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KCNH2Q12809 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KCNH2Q12809 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KCNH2Q12809 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNH2Q12809 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms