Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CPSF1Q10570 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CPSF1Q10570 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
CPSF1Q10570 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
CPSF1Q10570 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
CPSF1Q10570 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
CPSF1Q10570 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
CPSF1Q10570 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
CPSF1Q10570 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
CPSF1Q10570 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CPSF1Q10570 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CPSF1Q10570 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CPSF1Q10570 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CPSF1Q10570 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
CPSF1Q10570 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
CPSF1Q10570 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
CPSF1Q10570 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CPSF1Q10570 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CPSF1Q10570 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
CPSF1Q10570 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CPSF1Q10570 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
CPSF1Q10570 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
CPSF1Q10570 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
CPSF1Q10570 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
CPSF1Q10570 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
CPSF1Q10570 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
CPSF1Q10570 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
CPSF1Q10570 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
CPSF1Q10570 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
CPSF1Q10570 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
CPSF1Q10570 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
CPSF1Q10570 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
CPSF1Q10570 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CPSF1Q10570 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
CPSF1Q10570 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
CPSF1Q10570 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
CPSF1Q10570 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
CPSF1Q10570 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
CPSF1Q10570 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CPSF1Q10570 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
CPSF1Q10570 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
CPSF1Q10570 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
CPSF1Q10570 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
CPSF1Q10570 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
CPSF1Q10570 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.55
CPSF1Q10570 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.55
CPSF1Q10570 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CPSF1Q10570 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CPSF1Q10570 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CPSF1Q10570 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
CPSF1Q10570 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
CPSF1Q10570 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CPSF1Q10570 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CPSF1Q10570 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CPSF1Q10570 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CPSF1Q10570 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CPSF1Q10570 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CPSF1Q10570 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CPSF1Q10570 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CPSF1Q10570 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CPSF1Q10570 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CPSF1Q10570 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CPSF1Q10570 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CPSF1Q10570 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CPSF1Q10570 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CPSF1Q10570 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CPSF1Q10570 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CPSF1Q10570 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CPSF1Q10570 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CPSF1Q10570 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CPSF1Q10570 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CPSF1Q10570 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CPSF1Q10570 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CPSF1Q10570 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CPSF1Q10570 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CPSF1Q10570 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CPSF1Q10570 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CPSF1Q10570 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CPSF1Q10570 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CPSF1Q10570 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CPSF1Q10570 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CPSF1Q10570 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CPSF1Q10570 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CPSF1Q10570 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
CPSF1Q10570 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
CPSF1Q10570 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CPSF1Q10570 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
CPSF1Q10570 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CPSF1Q10570 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
CPSF1Q10570 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
CPSF1Q10570 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
CPSF1Q10570 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
CPSF1Q10570 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CPSF1Q10570 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CPSF1Q10570 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
CPSF1Q10570 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC37.02■■■■□ 3.52
CPSF1Q10570 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CPSF1Q10570 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC37■■■■□ 3.51
CPSF1Q10570 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
CPSF1Q10570 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
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