Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIPPLY1Q0D2K3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIPPLY1Q0D2K3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIPPLY1Q0D2K3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIPPLY1Q0D2K3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIPPLY1Q0D2K3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIPPLY1Q0D2K3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIPPLY1Q0D2K3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIPPLY1Q0D2K3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RIPPLY1Q0D2K3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RIPPLY1Q0D2K3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RIPPLY1Q0D2K3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RIPPLY1Q0D2K3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RIPPLY1Q0D2K3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIPPLY1Q0D2K3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIPPLY1Q0D2K3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIPPLY1Q0D2K3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RIPPLY1Q0D2K3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RIPPLY1Q0D2K3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIPPLY1Q0D2K3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIPPLY1Q0D2K3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIPPLY1Q0D2K3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIPPLY1Q0D2K3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIPPLY1Q0D2K3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIPPLY1Q0D2K3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIPPLY1Q0D2K3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIPPLY1Q0D2K3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIPPLY1Q0D2K3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIPPLY1Q0D2K3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIPPLY1Q0D2K3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIPPLY1Q0D2K3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIPPLY1Q0D2K3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIPPLY1Q0D2K3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIPPLY1Q0D2K3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIPPLY1Q0D2K3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIPPLY1Q0D2K3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIPPLY1Q0D2K3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIPPLY1Q0D2K3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIPPLY1Q0D2K3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIPPLY1Q0D2K3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIPPLY1Q0D2K3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIPPLY1Q0D2K3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIPPLY1Q0D2K3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIPPLY1Q0D2K3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIPPLY1Q0D2K3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RIPPLY1Q0D2K3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIPPLY1Q0D2K3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIPPLY1Q0D2K3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPPLY1Q0D2K3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPPLY1Q0D2K3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIPPLY1Q0D2K3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIPPLY1Q0D2K3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIPPLY1Q0D2K3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIPPLY1Q0D2K3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPPLY1Q0D2K3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPPLY1Q0D2K3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPPLY1Q0D2K3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIPPLY1Q0D2K3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIPPLY1Q0D2K3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPPLY1Q0D2K3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPPLY1Q0D2K3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIPPLY1Q0D2K3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIPPLY1Q0D2K3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIPPLY1Q0D2K3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPPLY1Q0D2K3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPPLY1Q0D2K3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIPPLY1Q0D2K3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIPPLY1Q0D2K3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIPPLY1Q0D2K3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIPPLY1Q0D2K3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIPPLY1Q0D2K3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIPPLY1Q0D2K3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIPPLY1Q0D2K3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIPPLY1Q0D2K3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIPPLY1Q0D2K3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIPPLY1Q0D2K3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIPPLY1Q0D2K3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIPPLY1Q0D2K3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIPPLY1Q0D2K3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIPPLY1Q0D2K3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIPPLY1Q0D2K3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIPPLY1Q0D2K3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIPPLY1Q0D2K3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIPPLY1Q0D2K3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIPPLY1Q0D2K3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIPPLY1Q0D2K3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIPPLY1Q0D2K3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIPPLY1Q0D2K3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIPPLY1Q0D2K3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIPPLY1Q0D2K3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIPPLY1Q0D2K3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIPPLY1Q0D2K3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIPPLY1Q0D2K3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIPPLY1Q0D2K3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIPPLY1Q0D2K3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms