Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD164Q04900 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD164Q04900 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD164Q04900 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD164Q04900 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD164Q04900 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD164Q04900 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD164Q04900 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD164Q04900 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD164Q04900 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD164Q04900 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD164Q04900 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CD164Q04900 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CD164Q04900 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD164Q04900 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD164Q04900 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD164Q04900 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD164Q04900 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CD164Q04900 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD164Q04900 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD164Q04900 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD164Q04900 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD164Q04900 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD164Q04900 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD164Q04900 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD164Q04900 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD164Q04900 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD164Q04900 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD164Q04900 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD164Q04900 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD164Q04900 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD164Q04900 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD164Q04900 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD164Q04900 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD164Q04900 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD164Q04900 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD164Q04900 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD164Q04900 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD164Q04900 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD164Q04900 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD164Q04900 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD164Q04900 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD164Q04900 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD164Q04900 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD164Q04900 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD164Q04900 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD164Q04900 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD164Q04900 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD164Q04900 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD164Q04900 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD164Q04900 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD164Q04900 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD164Q04900 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD164Q04900 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD164Q04900 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD164Q04900 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD164Q04900 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD164Q04900 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD164Q04900 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD164Q04900 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD164Q04900 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD164Q04900 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD164Q04900 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD164Q04900 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD164Q04900 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD164Q04900 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CD164Q04900 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CD164Q04900 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD164Q04900 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD164Q04900 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD164Q04900 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD164Q04900 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD164Q04900 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD164Q04900 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD164Q04900 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD164Q04900 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD164Q04900 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD164Q04900 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD164Q04900 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD164Q04900 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD164Q04900 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD164Q04900 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD164Q04900 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD164Q04900 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD164Q04900 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD164Q04900 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD164Q04900 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD164Q04900 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD164Q04900 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD164Q04900 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD164Q04900 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD164Q04900 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD164Q04900 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD164Q04900 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD164Q04900 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD164Q04900 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD164Q04900 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD164Q04900 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD164Q04900 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD164Q04900 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms