Protein–RNA interactions for Protein: Q04118

PRB3, Basic salivary proline-rich protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB3Q04118 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRB3Q04118 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRB3Q04118 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRB3Q04118 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRB3Q04118 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRB3Q04118 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRB3Q04118 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRB3Q04118 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRB3Q04118 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRB3Q04118 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRB3Q04118 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRB3Q04118 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRB3Q04118 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PRB3Q04118 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRB3Q04118 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRB3Q04118 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRB3Q04118 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRB3Q04118 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRB3Q04118 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRB3Q04118 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRB3Q04118 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRB3Q04118 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRB3Q04118 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRB3Q04118 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRB3Q04118 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRB3Q04118 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRB3Q04118 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRB3Q04118 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRB3Q04118 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRB3Q04118 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRB3Q04118 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRB3Q04118 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRB3Q04118 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRB3Q04118 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRB3Q04118 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRB3Q04118 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRB3Q04118 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRB3Q04118 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRB3Q04118 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRB3Q04118 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRB3Q04118 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRB3Q04118 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRB3Q04118 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRB3Q04118 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRB3Q04118 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRB3Q04118 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRB3Q04118 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRB3Q04118 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PRB3Q04118 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRB3Q04118 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRB3Q04118 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRB3Q04118 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRB3Q04118 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRB3Q04118 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRB3Q04118 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRB3Q04118 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRB3Q04118 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRB3Q04118 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRB3Q04118 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRB3Q04118 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRB3Q04118 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRB3Q04118 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRB3Q04118 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRB3Q04118 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRB3Q04118 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRB3Q04118 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRB3Q04118 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRB3Q04118 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRB3Q04118 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRB3Q04118 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRB3Q04118 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRB3Q04118 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRB3Q04118 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRB3Q04118 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRB3Q04118 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRB3Q04118 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRB3Q04118 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRB3Q04118 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRB3Q04118 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRB3Q04118 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PRB3Q04118 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRB3Q04118 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRB3Q04118 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRB3Q04118 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRB3Q04118 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRB3Q04118 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRB3Q04118 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRB3Q04118 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRB3Q04118 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRB3Q04118 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRB3Q04118 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRB3Q04118 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRB3Q04118 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRB3Q04118 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRB3Q04118 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRB3Q04118 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRB3Q04118 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PRB3Q04118 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRB3Q04118 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRB3Q04118 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms