Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PLOD1Q02809 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PLOD1Q02809 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PLOD1Q02809 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PLOD1Q02809 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PLOD1Q02809 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PLOD1Q02809 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PLOD1Q02809 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PLOD1Q02809 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PLOD1Q02809 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PLOD1Q02809 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PLOD1Q02809 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PLOD1Q02809 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PLOD1Q02809 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PLOD1Q02809 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PLOD1Q02809 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PLOD1Q02809 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PLOD1Q02809 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PLOD1Q02809 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PLOD1Q02809 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PLOD1Q02809 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PLOD1Q02809 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PLOD1Q02809 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PLOD1Q02809 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PLOD1Q02809 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PLOD1Q02809 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PLOD1Q02809 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PLOD1Q02809 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PLOD1Q02809 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PLOD1Q02809 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PLOD1Q02809 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PLOD1Q02809 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PLOD1Q02809 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PLOD1Q02809 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PLOD1Q02809 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PLOD1Q02809 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PLOD1Q02809 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLOD1Q02809 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLOD1Q02809 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PLOD1Q02809 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PLOD1Q02809 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PLOD1Q02809 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PLOD1Q02809 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PLOD1Q02809 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PLOD1Q02809 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PLOD1Q02809 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PLOD1Q02809 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PLOD1Q02809 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PLOD1Q02809 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PLOD1Q02809 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PLOD1Q02809 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PLOD1Q02809 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PLOD1Q02809 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PLOD1Q02809 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PLOD1Q02809 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PLOD1Q02809 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PLOD1Q02809 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PLOD1Q02809 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PLOD1Q02809 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PLOD1Q02809 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PLOD1Q02809 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PLOD1Q02809 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PLOD1Q02809 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PLOD1Q02809 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLOD1Q02809 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLOD1Q02809 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLOD1Q02809 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLOD1Q02809 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLOD1Q02809 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PLOD1Q02809 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PLOD1Q02809 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PLOD1Q02809 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PLOD1Q02809 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLOD1Q02809 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PLOD1Q02809 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PLOD1Q02809 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PLOD1Q02809 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PLOD1Q02809 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PLOD1Q02809 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PLOD1Q02809 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PLOD1Q02809 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PLOD1Q02809 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PLOD1Q02809 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PLOD1Q02809 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PLOD1Q02809 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PLOD1Q02809 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PLOD1Q02809 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PLOD1Q02809 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PLOD1Q02809 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PLOD1Q02809 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PLOD1Q02809 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PLOD1Q02809 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PLOD1Q02809 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PLOD1Q02809 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PLOD1Q02809 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PLOD1Q02809 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PLOD1Q02809 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PLOD1Q02809 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PLOD1Q02809 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLOD1Q02809 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms