Protein–RNA interactions for Protein: Q01130

SRSF2, Serine/arginine-rich splicing factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF2Q01130 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRSF2Q01130 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRSF2Q01130 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRSF2Q01130 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRSF2Q01130 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRSF2Q01130 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRSF2Q01130 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRSF2Q01130 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRSF2Q01130 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SRSF2Q01130 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRSF2Q01130 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRSF2Q01130 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRSF2Q01130 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRSF2Q01130 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRSF2Q01130 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRSF2Q01130 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRSF2Q01130 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRSF2Q01130 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRSF2Q01130 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRSF2Q01130 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRSF2Q01130 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRSF2Q01130 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRSF2Q01130 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRSF2Q01130 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRSF2Q01130 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRSF2Q01130 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRSF2Q01130 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SRSF2Q01130 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRSF2Q01130 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRSF2Q01130 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRSF2Q01130 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRSF2Q01130 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SRSF2Q01130 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRSF2Q01130 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRSF2Q01130 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRSF2Q01130 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRSF2Q01130 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRSF2Q01130 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRSF2Q01130 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRSF2Q01130 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRSF2Q01130 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRSF2Q01130 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRSF2Q01130 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRSF2Q01130 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRSF2Q01130 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRSF2Q01130 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRSF2Q01130 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SRSF2Q01130 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SRSF2Q01130 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRSF2Q01130 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SRSF2Q01130 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRSF2Q01130 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRSF2Q01130 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRSF2Q01130 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRSF2Q01130 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SRSF2Q01130 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRSF2Q01130 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRSF2Q01130 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRSF2Q01130 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRSF2Q01130 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRSF2Q01130 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRSF2Q01130 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRSF2Q01130 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRSF2Q01130 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRSF2Q01130 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRSF2Q01130 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SRSF2Q01130 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRSF2Q01130 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRSF2Q01130 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRSF2Q01130 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRSF2Q01130 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRSF2Q01130 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRSF2Q01130 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRSF2Q01130 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRSF2Q01130 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SRSF2Q01130 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SRSF2Q01130 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRSF2Q01130 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRSF2Q01130 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRSF2Q01130 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRSF2Q01130 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRSF2Q01130 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRSF2Q01130 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRSF2Q01130 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SRSF2Q01130 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRSF2Q01130 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRSF2Q01130 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRSF2Q01130 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRSF2Q01130 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRSF2Q01130 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRSF2Q01130 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRSF2Q01130 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRSF2Q01130 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SRSF2Q01130 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRSF2Q01130 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRSF2Q01130 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRSF2Q01130 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRSF2Q01130 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SRSF2Q01130 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRSF2Q01130 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms