Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HSF1Q00613 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HSF1Q00613 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HSF1Q00613 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HSF1Q00613 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HSF1Q00613 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HSF1Q00613 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HSF1Q00613 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSF1Q00613 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSF1Q00613 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSF1Q00613 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSF1Q00613 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSF1Q00613 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HSF1Q00613 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HSF1Q00613 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HSF1Q00613 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HSF1Q00613 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HSF1Q00613 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HSF1Q00613 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HSF1Q00613 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HSF1Q00613 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HSF1Q00613 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HSF1Q00613 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HSF1Q00613 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HSF1Q00613 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSF1Q00613 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSF1Q00613 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSF1Q00613 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HSF1Q00613 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HSF1Q00613 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HSF1Q00613 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HSF1Q00613 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSF1Q00613 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSF1Q00613 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSF1Q00613 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSF1Q00613 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSF1Q00613 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HSF1Q00613 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSF1Q00613 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HSF1Q00613 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HSF1Q00613 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSF1Q00613 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSF1Q00613 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HSF1Q00613 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSF1Q00613 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HSF1Q00613 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HSF1Q00613 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HSF1Q00613 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HSF1Q00613 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HSF1Q00613 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HSF1Q00613 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HSF1Q00613 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HSF1Q00613 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HSF1Q00613 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HSF1Q00613 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HSF1Q00613 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HSF1Q00613 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HSF1Q00613 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HSF1Q00613 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HSF1Q00613 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HSF1Q00613 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HSF1Q00613 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HSF1Q00613 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HSF1Q00613 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HSF1Q00613 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSF1Q00613 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HSF1Q00613 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HSF1Q00613 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HSF1Q00613 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HSF1Q00613 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HSF1Q00613 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HSF1Q00613 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HSF1Q00613 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HSF1Q00613 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HSF1Q00613 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HSF1Q00613 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HSF1Q00613 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HSF1Q00613 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HSF1Q00613 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HSF1Q00613 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HSF1Q00613 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSF1Q00613 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSF1Q00613 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSF1Q00613 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HSF1Q00613 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSF1Q00613 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSF1Q00613 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSF1Q00613 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSF1Q00613 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSF1Q00613 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSF1Q00613 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSF1Q00613 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSF1Q00613 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSF1Q00613 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSF1Q00613 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HSF1Q00613 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HSF1Q00613 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HSF1Q00613 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HSF1Q00613 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HSF1Q00613 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms