Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CDK17Q00537 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CDK17Q00537 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CDK17Q00537 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CDK17Q00537 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDK17Q00537 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CDK17Q00537 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CDK17Q00537 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CDK17Q00537 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDK17Q00537 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDK17Q00537 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CDK17Q00537 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CDK17Q00537 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CDK17Q00537 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDK17Q00537 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CDK17Q00537 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CDK17Q00537 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CDK17Q00537 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDK17Q00537 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDK17Q00537 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDK17Q00537 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CDK17Q00537 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CDK17Q00537 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CDK17Q00537 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CDK17Q00537 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CDK17Q00537 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CDK17Q00537 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDK17Q00537 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDK17Q00537 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDK17Q00537 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDK17Q00537 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDK17Q00537 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDK17Q00537 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDK17Q00537 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDK17Q00537 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDK17Q00537 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDK17Q00537 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDK17Q00537 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDK17Q00537 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDK17Q00537 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDK17Q00537 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDK17Q00537 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDK17Q00537 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDK17Q00537 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDK17Q00537 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDK17Q00537 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDK17Q00537 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CDK17Q00537 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CDK17Q00537 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CDK17Q00537 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDK17Q00537 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDK17Q00537 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDK17Q00537 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDK17Q00537 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDK17Q00537 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDK17Q00537 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDK17Q00537 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDK17Q00537 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CDK17Q00537 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDK17Q00537 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDK17Q00537 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDK17Q00537 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDK17Q00537 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDK17Q00537 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDK17Q00537 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDK17Q00537 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDK17Q00537 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDK17Q00537 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDK17Q00537 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDK17Q00537 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDK17Q00537 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDK17Q00537 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDK17Q00537 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CDK17Q00537 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDK17Q00537 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDK17Q00537 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDK17Q00537 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDK17Q00537 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDK17Q00537 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDK17Q00537 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDK17Q00537 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDK17Q00537 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDK17Q00537 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CDK17Q00537 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CDK17Q00537 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CDK17Q00537 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CDK17Q00537 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDK17Q00537 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDK17Q00537 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDK17Q00537 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDK17Q00537 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDK17Q00537 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDK17Q00537 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDK17Q00537 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDK17Q00537 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDK17Q00537 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDK17Q00537 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CDK17Q00537 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDK17Q00537 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDK17Q00537 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms