Protein–RNA interactions for Protein: P78413

IRX4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX4P78413 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IRX4P78413 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
IRX4P78413 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
IRX4P78413 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
IRX4P78413 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
IRX4P78413 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
IRX4P78413 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IRX4P78413 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IRX4P78413 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
IRX4P78413 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IRX4P78413 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IRX4P78413 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IRX4P78413 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
IRX4P78413 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
IRX4P78413 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
IRX4P78413 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
IRX4P78413 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
IRX4P78413 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IRX4P78413 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IRX4P78413 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IRX4P78413 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IRX4P78413 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IRX4P78413 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IRX4P78413 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IRX4P78413 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
IRX4P78413 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IRX4P78413 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IRX4P78413 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IRX4P78413 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
IRX4P78413 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
IRX4P78413 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
IRX4P78413 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
IRX4P78413 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
IRX4P78413 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IRX4P78413 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IRX4P78413 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
IRX4P78413 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
IRX4P78413 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
IRX4P78413 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IRX4P78413 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
IRX4P78413 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
IRX4P78413 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IRX4P78413 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IRX4P78413 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IRX4P78413 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IRX4P78413 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IRX4P78413 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
IRX4P78413 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IRX4P78413 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
IRX4P78413 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
IRX4P78413 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
IRX4P78413 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IRX4P78413 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IRX4P78413 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IRX4P78413 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IRX4P78413 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IRX4P78413 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
IRX4P78413 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IRX4P78413 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
IRX4P78413 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
IRX4P78413 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
IRX4P78413 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
IRX4P78413 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
IRX4P78413 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
IRX4P78413 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
IRX4P78413 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
IRX4P78413 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
IRX4P78413 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
IRX4P78413 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
IRX4P78413 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IRX4P78413 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
IRX4P78413 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IRX4P78413 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IRX4P78413 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IRX4P78413 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
IRX4P78413 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IRX4P78413 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IRX4P78413 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IRX4P78413 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IRX4P78413 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
IRX4P78413 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
IRX4P78413 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
IRX4P78413 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.54■■■□□ 2
IRX4P78413 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.54■■■□□ 2
IRX4P78413 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
IRX4P78413 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.53■■■□□ 2
IRX4P78413 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
IRX4P78413 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IRX4P78413 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
IRX4P78413 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
IRX4P78413 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IRX4P78413 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IRX4P78413 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IRX4P78413 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IRX4P78413 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IRX4P78413 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IRX4P78413 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
IRX4P78413 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IRX4P78413 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IRX4P78413 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms