Protein–RNA interactions for Protein: P62917

RPL8, 60S ribosomal protein L8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL8P62917 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RPL8P62917 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPL8P62917 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPL8P62917 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL8P62917 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL8P62917 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL8P62917 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL8P62917 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL8P62917 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL8P62917 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL8P62917 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL8P62917 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL8P62917 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL8P62917 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL8P62917 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL8P62917 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL8P62917 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPL8P62917 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPL8P62917 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL8P62917 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL8P62917 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL8P62917 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL8P62917 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL8P62917 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL8P62917 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RPL8P62917 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL8P62917 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL8P62917 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL8P62917 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL8P62917 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL8P62917 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL8P62917 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL8P62917 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL8P62917 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL8P62917 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL8P62917 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL8P62917 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL8P62917 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPL8P62917 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL8P62917 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL8P62917 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL8P62917 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL8P62917 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL8P62917 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL8P62917 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL8P62917 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL8P62917 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL8P62917 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL8P62917 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL8P62917 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL8P62917 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL8P62917 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL8P62917 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL8P62917 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL8P62917 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL8P62917 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL8P62917 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL8P62917 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL8P62917 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL8P62917 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL8P62917 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL8P62917 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL8P62917 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL8P62917 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL8P62917 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL8P62917 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL8P62917 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL8P62917 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL8P62917 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL8P62917 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL8P62917 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL8P62917 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RPL8P62917 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPL8P62917 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPL8P62917 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL8P62917 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL8P62917 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL8P62917 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL8P62917 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL8P62917 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL8P62917 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL8P62917 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL8P62917 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL8P62917 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL8P62917 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL8P62917 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL8P62917 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPL8P62917 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPL8P62917 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL8P62917 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL8P62917 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL8P62917 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL8P62917 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL8P62917 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL8P62917 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL8P62917 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL8P62917 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL8P62917 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL8P62917 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL8P62917 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms