Protein–RNA interactions for Protein: P62502

LCN6, Epididymal-specific lipocalin-6, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN6P62502 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LCN6P62502 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LCN6P62502 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LCN6P62502 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LCN6P62502 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LCN6P62502 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LCN6P62502 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LCN6P62502 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LCN6P62502 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCN6P62502 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LCN6P62502 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LCN6P62502 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LCN6P62502 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LCN6P62502 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LCN6P62502 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LCN6P62502 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LCN6P62502 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCN6P62502 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LCN6P62502 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LCN6P62502 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LCN6P62502 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LCN6P62502 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LCN6P62502 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LCN6P62502 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LCN6P62502 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LCN6P62502 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LCN6P62502 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LCN6P62502 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LCN6P62502 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LCN6P62502 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LCN6P62502 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LCN6P62502 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LCN6P62502 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LCN6P62502 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LCN6P62502 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LCN6P62502 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LCN6P62502 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LCN6P62502 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LCN6P62502 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LCN6P62502 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LCN6P62502 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LCN6P62502 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LCN6P62502 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LCN6P62502 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LCN6P62502 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCN6P62502 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCN6P62502 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCN6P62502 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCN6P62502 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LCN6P62502 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LCN6P62502 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LCN6P62502 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LCN6P62502 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LCN6P62502 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LCN6P62502 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LCN6P62502 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LCN6P62502 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LCN6P62502 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LCN6P62502 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LCN6P62502 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LCN6P62502 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LCN6P62502 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LCN6P62502 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LCN6P62502 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LCN6P62502 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LCN6P62502 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LCN6P62502 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LCN6P62502 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LCN6P62502 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LCN6P62502 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LCN6P62502 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LCN6P62502 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LCN6P62502 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LCN6P62502 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCN6P62502 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCN6P62502 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LCN6P62502 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LCN6P62502 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LCN6P62502 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LCN6P62502 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LCN6P62502 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LCN6P62502 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LCN6P62502 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LCN6P62502 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LCN6P62502 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LCN6P62502 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LCN6P62502 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LCN6P62502 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LCN6P62502 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LCN6P62502 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LCN6P62502 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LCN6P62502 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LCN6P62502 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LCN6P62502 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LCN6P62502 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LCN6P62502 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LCN6P62502 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LCN6P62502 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LCN6P62502 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LCN6P62502 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms