Protein–RNA interactions for Protein: P62266

RPS23, 40S ribosomal protein S23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS23P62266 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS23P62266 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS23P62266 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RPS23P62266 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS23P62266 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS23P62266 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS23P62266 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS23P62266 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS23P62266 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS23P62266 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS23P62266 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS23P62266 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS23P62266 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS23P62266 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS23P62266 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS23P62266 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS23P62266 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS23P62266 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS23P62266 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS23P62266 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPS23P62266 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPS23P62266 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS23P62266 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS23P62266 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS23P62266 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS23P62266 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS23P62266 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS23P62266 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS23P62266 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS23P62266 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS23P62266 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS23P62266 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS23P62266 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS23P62266 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPS23P62266 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS23P62266 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS23P62266 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS23P62266 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS23P62266 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS23P62266 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS23P62266 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS23P62266 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS23P62266 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS23P62266 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS23P62266 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS23P62266 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS23P62266 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS23P62266 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS23P62266 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS23P62266 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS23P62266 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS23P62266 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS23P62266 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS23P62266 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS23P62266 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS23P62266 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS23P62266 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS23P62266 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS23P62266 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS23P62266 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS23P62266 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS23P62266 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS23P62266 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS23P62266 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS23P62266 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS23P62266 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS23P62266 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS23P62266 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS23P62266 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS23P62266 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS23P62266 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS23P62266 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS23P62266 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS23P62266 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS23P62266 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS23P62266 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS23P62266 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS23P62266 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS23P62266 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS23P62266 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS23P62266 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS23P62266 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS23P62266 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS23P62266 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS23P62266 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS23P62266 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS23P62266 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS23P62266 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS23P62266 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS23P62266 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS23P62266 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS23P62266 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS23P62266 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS23P62266 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS23P62266 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS23P62266 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS23P62266 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS23P62266 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS23P62266 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS23P62266 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms