Protein–RNA interactions for Protein: P62191

PSMC1, 26S proteasome regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC1P62191 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PSMC1P62191 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PSMC1P62191 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PSMC1P62191 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PSMC1P62191 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PSMC1P62191 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PSMC1P62191 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PSMC1P62191 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PSMC1P62191 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PSMC1P62191 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PSMC1P62191 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PSMC1P62191 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PSMC1P62191 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PSMC1P62191 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PSMC1P62191 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PSMC1P62191 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PSMC1P62191 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PSMC1P62191 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PSMC1P62191 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PSMC1P62191 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PSMC1P62191 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
PSMC1P62191 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PSMC1P62191 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PSMC1P62191 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PSMC1P62191 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PSMC1P62191 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PSMC1P62191 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PSMC1P62191 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PSMC1P62191 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PSMC1P62191 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PSMC1P62191 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PSMC1P62191 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PSMC1P62191 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PSMC1P62191 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PSMC1P62191 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PSMC1P62191 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PSMC1P62191 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PSMC1P62191 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PSMC1P62191 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PSMC1P62191 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PSMC1P62191 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PSMC1P62191 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PSMC1P62191 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PSMC1P62191 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PSMC1P62191 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PSMC1P62191 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PSMC1P62191 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PSMC1P62191 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PSMC1P62191 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PSMC1P62191 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PSMC1P62191 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PSMC1P62191 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PSMC1P62191 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PSMC1P62191 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PSMC1P62191 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PSMC1P62191 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PSMC1P62191 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PSMC1P62191 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PSMC1P62191 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PSMC1P62191 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PSMC1P62191 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PSMC1P62191 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PSMC1P62191 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PSMC1P62191 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PSMC1P62191 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PSMC1P62191 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PSMC1P62191 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PSMC1P62191 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PSMC1P62191 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PSMC1P62191 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PSMC1P62191 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PSMC1P62191 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PSMC1P62191 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PSMC1P62191 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSMC1P62191 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSMC1P62191 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSMC1P62191 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSMC1P62191 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSMC1P62191 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PSMC1P62191 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PSMC1P62191 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PSMC1P62191 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PSMC1P62191 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PSMC1P62191 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSMC1P62191 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSMC1P62191 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSMC1P62191 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSMC1P62191 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSMC1P62191 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSMC1P62191 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSMC1P62191 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSMC1P62191 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PSMC1P62191 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PSMC1P62191 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PSMC1P62191 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PSMC1P62191 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSMC1P62191 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSMC1P62191 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PSMC1P62191 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PSMC1P62191 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms