Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE2NP61088 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE2NP61088 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE2NP61088 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE2NP61088 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE2NP61088 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE2NP61088 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE2NP61088 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE2NP61088 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE2NP61088 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE2NP61088 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE2NP61088 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE2NP61088 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE2NP61088 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE2NP61088 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE2NP61088 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE2NP61088 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE2NP61088 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE2NP61088 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE2NP61088 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE2NP61088 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE2NP61088 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2NP61088 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2NP61088 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2NP61088 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2NP61088 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE2NP61088 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE2NP61088 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE2NP61088 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE2NP61088 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2NP61088 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2NP61088 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE2NP61088 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE2NP61088 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE2NP61088 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2NP61088 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2NP61088 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE2NP61088 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE2NP61088 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE2NP61088 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE2NP61088 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE2NP61088 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE2NP61088 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2NP61088 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE2NP61088 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBE2NP61088 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBE2NP61088 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE2NP61088 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE2NP61088 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE2NP61088 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2NP61088 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2NP61088 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2NP61088 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2NP61088 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2NP61088 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE2NP61088 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE2NP61088 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE2NP61088 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE2NP61088 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE2NP61088 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE2NP61088 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE2NP61088 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE2NP61088 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE2NP61088 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE2NP61088 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2NP61088 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2NP61088 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2NP61088 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2NP61088 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE2NP61088 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE2NP61088 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE2NP61088 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE2NP61088 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE2NP61088 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2NP61088 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2NP61088 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2NP61088 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2NP61088 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2NP61088 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2NP61088 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2NP61088 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2NP61088 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2NP61088 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2NP61088 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2NP61088 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2NP61088 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2NP61088 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2NP61088 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2NP61088 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2NP61088 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2NP61088 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2NP61088 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2NP61088 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2NP61088 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE2NP61088 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2NP61088 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2NP61088 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2NP61088 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2NP61088 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2NP61088 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms