Protein–RNA interactions for Protein: P59045

NLRP11, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,033 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP11P59045 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
NLRP11P59045 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NLRP11P59045 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NLRP11P59045 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NLRP11P59045 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NLRP11P59045 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NLRP11P59045 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NLRP11P59045 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NLRP11P59045 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
NLRP11P59045 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NLRP11P59045 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NLRP11P59045 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NLRP11P59045 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NLRP11P59045 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NLRP11P59045 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NLRP11P59045 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
NLRP11P59045 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NLRP11P59045 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NLRP11P59045 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NLRP11P59045 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NLRP11P59045 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NLRP11P59045 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NLRP11P59045 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
NLRP11P59045 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NLRP11P59045 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NLRP11P59045 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NLRP11P59045 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NLRP11P59045 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NLRP11P59045 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NLRP11P59045 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NLRP11P59045 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30■■■□□ 2.39
NLRP11P59045 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NLRP11P59045 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NLRP11P59045 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NLRP11P59045 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NLRP11P59045 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
NLRP11P59045 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NLRP11P59045 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NLRP11P59045 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NLRP11P59045 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NLRP11P59045 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NLRP11P59045 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NLRP11P59045 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NLRP11P59045 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NLRP11P59045 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NLRP11P59045 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NLRP11P59045 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NLRP11P59045 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NLRP11P59045 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NLRP11P59045 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NLRP11P59045 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NLRP11P59045 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NLRP11P59045 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NLRP11P59045 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NLRP11P59045 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NLRP11P59045 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NLRP11P59045 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NLRP11P59045 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NLRP11P59045 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NLRP11P59045 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
NLRP11P59045 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NLRP11P59045 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NLRP11P59045 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
NLRP11P59045 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NLRP11P59045 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NLRP11P59045 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NLRP11P59045 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NLRP11P59045 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
NLRP11P59045 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NLRP11P59045 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NLRP11P59045 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NLRP11P59045 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NLRP11P59045 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NLRP11P59045 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NLRP11P59045 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NLRP11P59045 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NLRP11P59045 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NLRP11P59045 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NLRP11P59045 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NLRP11P59045 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NLRP11P59045 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NLRP11P59045 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NLRP11P59045 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NLRP11P59045 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NLRP11P59045 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NLRP11P59045 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NLRP11P59045 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NLRP11P59045 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
NLRP11P59045 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NLRP11P59045 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NLRP11P59045 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NLRP11P59045 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NLRP11P59045 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NLRP11P59045 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NLRP11P59045 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NLRP11P59045 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NLRP11P59045 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NLRP11P59045 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
NLRP11P59045 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
NLRP11P59045 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms