Protein–RNA interactions for Protein: P56703

WNT3, Proto-oncogene Wnt-3, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WNT3P56703 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
WNT3P56703 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
WNT3P56703 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
WNT3P56703 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
WNT3P56703 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
WNT3P56703 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
WNT3P56703 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
WNT3P56703 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
WNT3P56703 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
WNT3P56703 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
WNT3P56703 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
WNT3P56703 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
WNT3P56703 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
WNT3P56703 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
WNT3P56703 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
WNT3P56703 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
WNT3P56703 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
WNT3P56703 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
WNT3P56703 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
WNT3P56703 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
WNT3P56703 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
WNT3P56703 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
WNT3P56703 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
WNT3P56703 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
WNT3P56703 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
WNT3P56703 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
WNT3P56703 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
WNT3P56703 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
WNT3P56703 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
WNT3P56703 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
WNT3P56703 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
WNT3P56703 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
WNT3P56703 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
WNT3P56703 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
WNT3P56703 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
WNT3P56703 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
WNT3P56703 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
WNT3P56703 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
WNT3P56703 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
WNT3P56703 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
WNT3P56703 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
WNT3P56703 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
WNT3P56703 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
WNT3P56703 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
WNT3P56703 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
WNT3P56703 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
WNT3P56703 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
WNT3P56703 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
WNT3P56703 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
WNT3P56703 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
WNT3P56703 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
WNT3P56703 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
WNT3P56703 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
WNT3P56703 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
WNT3P56703 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
WNT3P56703 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
WNT3P56703 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
WNT3P56703 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
WNT3P56703 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
WNT3P56703 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
WNT3P56703 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
WNT3P56703 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
WNT3P56703 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
WNT3P56703 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
WNT3P56703 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
WNT3P56703 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
WNT3P56703 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
WNT3P56703 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
WNT3P56703 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
WNT3P56703 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
WNT3P56703 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
WNT3P56703 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
WNT3P56703 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
WNT3P56703 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
WNT3P56703 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
WNT3P56703 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
WNT3P56703 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
WNT3P56703 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
WNT3P56703 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
WNT3P56703 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
WNT3P56703 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
WNT3P56703 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
WNT3P56703 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
WNT3P56703 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
WNT3P56703 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
WNT3P56703 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
WNT3P56703 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
WNT3P56703 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
WNT3P56703 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
WNT3P56703 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
WNT3P56703 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
WNT3P56703 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
WNT3P56703 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
WNT3P56703 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
WNT3P56703 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
WNT3P56703 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
WNT3P56703 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
WNT3P56703 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
WNT3P56703 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
WNT3P56703 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms