Protein–RNA interactions for Protein: P56278

MTCP1, Protein p13 MTCP-1, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTCP1P56278 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTCP1P56278 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTCP1P56278 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTCP1P56278 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTCP1P56278 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTCP1P56278 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTCP1P56278 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTCP1P56278 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTCP1P56278 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTCP1P56278 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTCP1P56278 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTCP1P56278 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTCP1P56278 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTCP1P56278 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MTCP1P56278 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTCP1P56278 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTCP1P56278 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTCP1P56278 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTCP1P56278 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTCP1P56278 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTCP1P56278 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTCP1P56278 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTCP1P56278 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTCP1P56278 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTCP1P56278 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTCP1P56278 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTCP1P56278 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTCP1P56278 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTCP1P56278 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTCP1P56278 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTCP1P56278 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTCP1P56278 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTCP1P56278 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTCP1P56278 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTCP1P56278 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTCP1P56278 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTCP1P56278 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTCP1P56278 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTCP1P56278 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTCP1P56278 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTCP1P56278 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTCP1P56278 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTCP1P56278 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTCP1P56278 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTCP1P56278 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTCP1P56278 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTCP1P56278 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTCP1P56278 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTCP1P56278 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MTCP1P56278 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTCP1P56278 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTCP1P56278 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTCP1P56278 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTCP1P56278 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTCP1P56278 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTCP1P56278 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTCP1P56278 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTCP1P56278 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTCP1P56278 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTCP1P56278 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTCP1P56278 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTCP1P56278 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTCP1P56278 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MTCP1P56278 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MTCP1P56278 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MTCP1P56278 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MTCP1P56278 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MTCP1P56278 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MTCP1P56278 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTCP1P56278 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTCP1P56278 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTCP1P56278 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTCP1P56278 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTCP1P56278 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTCP1P56278 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTCP1P56278 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTCP1P56278 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTCP1P56278 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MTCP1P56278 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTCP1P56278 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTCP1P56278 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTCP1P56278 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTCP1P56278 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTCP1P56278 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTCP1P56278 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTCP1P56278 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTCP1P56278 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTCP1P56278 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTCP1P56278 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTCP1P56278 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTCP1P56278 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTCP1P56278 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTCP1P56278 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTCP1P56278 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTCP1P56278 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTCP1P56278 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTCP1P56278 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTCP1P56278 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTCP1P56278 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTCP1P56278 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms