Protein–RNA interactions for Protein: P56199

ITGA1, Integrin alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA1P56199 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGA1P56199 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGA1P56199 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGA1P56199 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGA1P56199 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGA1P56199 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGA1P56199 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGA1P56199 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGA1P56199 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGA1P56199 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGA1P56199 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGA1P56199 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGA1P56199 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGA1P56199 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGA1P56199 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGA1P56199 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGA1P56199 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGA1P56199 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGA1P56199 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGA1P56199 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGA1P56199 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGA1P56199 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGA1P56199 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGA1P56199 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGA1P56199 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGA1P56199 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGA1P56199 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGA1P56199 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ITGA1P56199 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ITGA1P56199 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGA1P56199 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGA1P56199 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGA1P56199 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGA1P56199 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGA1P56199 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGA1P56199 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGA1P56199 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGA1P56199 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGA1P56199 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGA1P56199 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGA1P56199 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGA1P56199 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGA1P56199 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGA1P56199 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGA1P56199 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGA1P56199 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGA1P56199 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGA1P56199 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGA1P56199 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGA1P56199 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGA1P56199 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGA1P56199 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGA1P56199 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGA1P56199 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGA1P56199 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
ITGA1P56199 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ITGA1P56199 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGA1P56199 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGA1P56199 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGA1P56199 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGA1P56199 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGA1P56199 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGA1P56199 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGA1P56199 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGA1P56199 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGA1P56199 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGA1P56199 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGA1P56199 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGA1P56199 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGA1P56199 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGA1P56199 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGA1P56199 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGA1P56199 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGA1P56199 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGA1P56199 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGA1P56199 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGA1P56199 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGA1P56199 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGA1P56199 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGA1P56199 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGA1P56199 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGA1P56199 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGA1P56199 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGA1P56199 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGA1P56199 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGA1P56199 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGA1P56199 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGA1P56199 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGA1P56199 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGA1P56199 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGA1P56199 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGA1P56199 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGA1P56199 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGA1P56199 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ITGA1P56199 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGA1P56199 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGA1P56199 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGA1P56199 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGA1P56199 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGA1P56199 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms