Protein–RNA interactions for Protein: P56199

ITGA1, Integrin alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA1P56199 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
ITGA1P56199 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
ITGA1P56199 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
ITGA1P56199 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
ITGA1P56199 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
ITGA1P56199 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
ITGA1P56199 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
ITGA1P56199 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
ITGA1P56199 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ITGA1P56199 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ITGA1P56199 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ITGA1P56199 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ITGA1P56199 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ITGA1P56199 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
ITGA1P56199 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ITGA1P56199 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ITGA1P56199 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ITGA1P56199 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ITGA1P56199 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ITGA1P56199 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ITGA1P56199 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ITGA1P56199 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ITGA1P56199 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ITGA1P56199 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ITGA1P56199 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ITGA1P56199 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ITGA1P56199 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ITGA1P56199 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
ITGA1P56199 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ITGA1P56199 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ITGA1P56199 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ITGA1P56199 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ITGA1P56199 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ITGA1P56199 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ITGA1P56199 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ITGA1P56199 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
ITGA1P56199 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ITGA1P56199 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ITGA1P56199 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ITGA1P56199 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ITGA1P56199 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ITGA1P56199 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ITGA1P56199 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ITGA1P56199 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ITGA1P56199 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ITGA1P56199 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ITGA1P56199 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ITGA1P56199 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ITGA1P56199 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ITGA1P56199 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ITGA1P56199 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ITGA1P56199 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ITGA1P56199 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ITGA1P56199 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGA1P56199 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ITGA1P56199 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ITGA1P56199 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGA1P56199 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
ITGA1P56199 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITGA1P56199 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ITGA1P56199 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ITGA1P56199 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ITGA1P56199 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ITGA1P56199 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITGA1P56199 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ITGA1P56199 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ITGA1P56199 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ITGA1P56199 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGA1P56199 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITGA1P56199 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITGA1P56199 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITGA1P56199 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGA1P56199 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGA1P56199 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGA1P56199 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
ITGA1P56199 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGA1P56199 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGA1P56199 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ITGA1P56199 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGA1P56199 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGA1P56199 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ITGA1P56199 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITGA1P56199 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGA1P56199 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ITGA1P56199 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ITGA1P56199 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGA1P56199 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITGA1P56199 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITGA1P56199 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGA1P56199 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ITGA1P56199 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ITGA1P56199 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ITGA1P56199 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGA1P56199 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGA1P56199 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITGA1P56199 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITGA1P56199 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITGA1P56199 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITGA1P56199 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITGA1P56199 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms