Protein–RNA interactions for Protein: P55769

SNU13, NHP2-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNU13P55769 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNU13P55769 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SNU13P55769 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNU13P55769 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNU13P55769 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNU13P55769 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNU13P55769 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNU13P55769 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNU13P55769 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNU13P55769 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNU13P55769 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNU13P55769 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNU13P55769 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNU13P55769 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNU13P55769 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNU13P55769 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNU13P55769 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNU13P55769 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNU13P55769 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNU13P55769 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNU13P55769 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNU13P55769 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNU13P55769 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNU13P55769 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNU13P55769 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNU13P55769 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNU13P55769 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNU13P55769 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNU13P55769 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNU13P55769 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNU13P55769 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNU13P55769 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNU13P55769 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNU13P55769 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNU13P55769 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNU13P55769 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNU13P55769 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNU13P55769 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNU13P55769 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNU13P55769 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNU13P55769 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNU13P55769 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNU13P55769 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNU13P55769 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNU13P55769 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNU13P55769 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SNU13P55769 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNU13P55769 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNU13P55769 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNU13P55769 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNU13P55769 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNU13P55769 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNU13P55769 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNU13P55769 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNU13P55769 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNU13P55769 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNU13P55769 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNU13P55769 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNU13P55769 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNU13P55769 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNU13P55769 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNU13P55769 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNU13P55769 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SNU13P55769 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNU13P55769 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNU13P55769 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNU13P55769 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNU13P55769 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNU13P55769 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNU13P55769 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNU13P55769 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNU13P55769 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNU13P55769 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNU13P55769 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNU13P55769 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNU13P55769 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNU13P55769 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNU13P55769 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNU13P55769 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNU13P55769 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNU13P55769 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNU13P55769 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNU13P55769 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNU13P55769 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNU13P55769 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNU13P55769 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNU13P55769 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNU13P55769 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SNU13P55769 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNU13P55769 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNU13P55769 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNU13P55769 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNU13P55769 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNU13P55769 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SNU13P55769 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNU13P55769 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNU13P55769 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNU13P55769 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNU13P55769 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNU13P55769 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms