Protein–RNA interactions for Protein: P55316

FOXG1, Forkhead box protein G1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXG1P55316 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXG1P55316 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXG1P55316 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXG1P55316 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXG1P55316 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXG1P55316 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXG1P55316 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXG1P55316 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXG1P55316 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXG1P55316 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXG1P55316 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXG1P55316 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXG1P55316 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXG1P55316 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXG1P55316 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXG1P55316 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXG1P55316 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXG1P55316 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXG1P55316 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXG1P55316 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXG1P55316 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXG1P55316 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXG1P55316 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXG1P55316 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXG1P55316 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXG1P55316 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXG1P55316 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXG1P55316 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXG1P55316 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXG1P55316 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FOXG1P55316 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FOXG1P55316 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXG1P55316 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXG1P55316 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXG1P55316 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXG1P55316 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXG1P55316 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXG1P55316 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXG1P55316 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXG1P55316 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXG1P55316 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXG1P55316 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXG1P55316 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXG1P55316 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXG1P55316 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXG1P55316 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXG1P55316 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXG1P55316 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXG1P55316 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXG1P55316 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXG1P55316 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXG1P55316 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXG1P55316 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXG1P55316 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXG1P55316 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXG1P55316 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXG1P55316 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXG1P55316 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXG1P55316 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXG1P55316 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXG1P55316 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXG1P55316 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FOXG1P55316 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FOXG1P55316 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXG1P55316 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXG1P55316 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXG1P55316 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXG1P55316 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXG1P55316 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXG1P55316 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXG1P55316 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXG1P55316 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXG1P55316 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXG1P55316 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXG1P55316 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXG1P55316 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXG1P55316 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXG1P55316 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXG1P55316 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXG1P55316 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXG1P55316 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXG1P55316 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXG1P55316 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXG1P55316 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXG1P55316 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXG1P55316 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXG1P55316 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXG1P55316 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXG1P55316 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXG1P55316 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXG1P55316 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXG1P55316 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXG1P55316 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXG1P55316 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXG1P55316 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXG1P55316 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXG1P55316 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXG1P55316 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXG1P55316 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXG1P55316 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms