Protein–RNA interactions for Protein: P55273

CDKN2D, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2DP55273 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDKN2DP55273 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDKN2DP55273 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDKN2DP55273 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDKN2DP55273 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDKN2DP55273 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDKN2DP55273 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDKN2DP55273 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDKN2DP55273 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDKN2DP55273 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDKN2DP55273 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDKN2DP55273 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDKN2DP55273 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDKN2DP55273 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDKN2DP55273 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDKN2DP55273 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDKN2DP55273 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDKN2DP55273 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDKN2DP55273 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDKN2DP55273 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDKN2DP55273 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDKN2DP55273 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDKN2DP55273 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDKN2DP55273 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CDKN2DP55273 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDKN2DP55273 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDKN2DP55273 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDKN2DP55273 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CDKN2DP55273 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDKN2DP55273 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDKN2DP55273 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDKN2DP55273 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDKN2DP55273 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDKN2DP55273 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDKN2DP55273 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDKN2DP55273 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDKN2DP55273 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDKN2DP55273 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDKN2DP55273 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDKN2DP55273 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDKN2DP55273 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDKN2DP55273 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDKN2DP55273 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDKN2DP55273 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDKN2DP55273 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDKN2DP55273 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDKN2DP55273 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDKN2DP55273 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDKN2DP55273 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CDKN2DP55273 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDKN2DP55273 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CDKN2DP55273 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDKN2DP55273 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDKN2DP55273 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDKN2DP55273 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDKN2DP55273 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDKN2DP55273 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CDKN2DP55273 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDKN2DP55273 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDKN2DP55273 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDKN2DP55273 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDKN2DP55273 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDKN2DP55273 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDKN2DP55273 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDKN2DP55273 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDKN2DP55273 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDKN2DP55273 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDKN2DP55273 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CDKN2DP55273 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDKN2DP55273 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDKN2DP55273 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDKN2DP55273 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDKN2DP55273 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDKN2DP55273 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDKN2DP55273 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDKN2DP55273 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDKN2DP55273 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
CDKN2DP55273 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDKN2DP55273 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDKN2DP55273 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDKN2DP55273 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDKN2DP55273 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDKN2DP55273 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDKN2DP55273 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDKN2DP55273 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CDKN2DP55273 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDKN2DP55273 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDKN2DP55273 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDKN2DP55273 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDKN2DP55273 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDKN2DP55273 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDKN2DP55273 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDKN2DP55273 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDKN2DP55273 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDKN2DP55273 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDKN2DP55273 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CDKN2DP55273 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDKN2DP55273 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CDKN2DP55273 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CDKN2DP55273 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms