Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
COPAP53621 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
COPAP53621 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COPAP53621 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
COPAP53621 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
COPAP53621 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
COPAP53621 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
COPAP53621 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COPAP53621 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COPAP53621 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COPAP53621 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COPAP53621 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COPAP53621 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
COPAP53621 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
COPAP53621 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
COPAP53621 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COPAP53621 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COPAP53621 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COPAP53621 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
COPAP53621 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
COPAP53621 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
COPAP53621 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
COPAP53621 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
COPAP53621 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
COPAP53621 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
COPAP53621 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
COPAP53621 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
COPAP53621 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COPAP53621 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
COPAP53621 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COPAP53621 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
COPAP53621 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COPAP53621 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
COPAP53621 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
COPAP53621 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
COPAP53621 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
COPAP53621 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
COPAP53621 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
COPAP53621 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
COPAP53621 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
COPAP53621 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
COPAP53621 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COPAP53621 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COPAP53621 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COPAP53621 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
COPAP53621 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
COPAP53621 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
COPAP53621 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COPAP53621 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
COPAP53621 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COPAP53621 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COPAP53621 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COPAP53621 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
COPAP53621 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COPAP53621 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COPAP53621 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
COPAP53621 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
COPAP53621 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
COPAP53621 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COPAP53621 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COPAP53621 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COPAP53621 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COPAP53621 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COPAP53621 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COPAP53621 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
COPAP53621 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COPAP53621 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
COPAP53621 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
COPAP53621 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COPAP53621 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COPAP53621 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COPAP53621 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
COPAP53621 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
COPAP53621 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
COPAP53621 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COPAP53621 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COPAP53621 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
COPAP53621 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COPAP53621 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COPAP53621 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
COPAP53621 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COPAP53621 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COPAP53621 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
COPAP53621 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COPAP53621 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
COPAP53621 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COPAP53621 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COPAP53621 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COPAP53621 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COPAP53621 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COPAP53621 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COPAP53621 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COPAP53621 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COPAP53621 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COPAP53621 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
COPAP53621 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COPAP53621 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COPAP53621 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COPAP53621 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COPAP53621 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms