Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
THOP1P52888 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
THOP1P52888 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
THOP1P52888 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
THOP1P52888 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
THOP1P52888 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
THOP1P52888 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
THOP1P52888 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
THOP1P52888 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
THOP1P52888 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
THOP1P52888 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
THOP1P52888 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
THOP1P52888 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
THOP1P52888 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
THOP1P52888 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
THOP1P52888 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
THOP1P52888 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
THOP1P52888 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
THOP1P52888 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
THOP1P52888 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
THOP1P52888 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
THOP1P52888 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
THOP1P52888 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
THOP1P52888 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
THOP1P52888 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
THOP1P52888 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
THOP1P52888 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
THOP1P52888 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
THOP1P52888 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
THOP1P52888 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
THOP1P52888 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
THOP1P52888 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
THOP1P52888 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
THOP1P52888 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
THOP1P52888 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
THOP1P52888 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
THOP1P52888 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
THOP1P52888 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
THOP1P52888 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
THOP1P52888 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
THOP1P52888 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
THOP1P52888 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
THOP1P52888 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
THOP1P52888 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
THOP1P52888 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
THOP1P52888 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
THOP1P52888 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
THOP1P52888 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
THOP1P52888 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
THOP1P52888 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
THOP1P52888 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
THOP1P52888 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
THOP1P52888 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
THOP1P52888 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
THOP1P52888 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
THOP1P52888 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
THOP1P52888 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
THOP1P52888 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
THOP1P52888 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
THOP1P52888 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
THOP1P52888 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
THOP1P52888 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
THOP1P52888 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
THOP1P52888 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
THOP1P52888 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
THOP1P52888 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
THOP1P52888 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
THOP1P52888 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
THOP1P52888 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
THOP1P52888 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
THOP1P52888 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
THOP1P52888 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
THOP1P52888 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
THOP1P52888 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
THOP1P52888 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
THOP1P52888 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
THOP1P52888 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
THOP1P52888 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
THOP1P52888 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
THOP1P52888 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
THOP1P52888 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
THOP1P52888 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
THOP1P52888 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
THOP1P52888 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
THOP1P52888 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
THOP1P52888 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
THOP1P52888 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
THOP1P52888 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
THOP1P52888 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
THOP1P52888 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
THOP1P52888 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
THOP1P52888 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
THOP1P52888 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
THOP1P52888 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
THOP1P52888 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
THOP1P52888 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
THOP1P52888 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
THOP1P52888 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
THOP1P52888 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
THOP1P52888 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms