Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PGDP52209 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PGDP52209 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PGDP52209 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PGDP52209 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PGDP52209 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PGDP52209 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PGDP52209 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PGDP52209 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PGDP52209 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PGDP52209 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PGDP52209 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PGDP52209 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PGDP52209 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PGDP52209 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PGDP52209 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PGDP52209 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PGDP52209 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PGDP52209 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PGDP52209 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PGDP52209 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PGDP52209 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PGDP52209 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PGDP52209 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PGDP52209 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PGDP52209 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PGDP52209 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PGDP52209 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PGDP52209 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PGDP52209 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PGDP52209 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PGDP52209 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PGDP52209 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PGDP52209 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PGDP52209 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PGDP52209 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PGDP52209 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PGDP52209 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PGDP52209 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PGDP52209 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PGDP52209 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PGDP52209 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PGDP52209 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PGDP52209 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PGDP52209 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PGDP52209 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PGDP52209 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PGDP52209 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PGDP52209 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PGDP52209 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PGDP52209 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PGDP52209 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PGDP52209 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PGDP52209 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PGDP52209 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PGDP52209 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PGDP52209 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PGDP52209 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PGDP52209 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PGDP52209 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PGDP52209 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PGDP52209 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PGDP52209 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGDP52209 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGDP52209 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGDP52209 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGDP52209 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGDP52209 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGDP52209 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGDP52209 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGDP52209 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGDP52209 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PGDP52209 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PGDP52209 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PGDP52209 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PGDP52209 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PGDP52209 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PGDP52209 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PGDP52209 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PGDP52209 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PGDP52209 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PGDP52209 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PGDP52209 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PGDP52209 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PGDP52209 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PGDP52209 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PGDP52209 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PGDP52209 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PGDP52209 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PGDP52209 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PGDP52209 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PGDP52209 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PGDP52209 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PGDP52209 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PGDP52209 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PGDP52209 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PGDP52209 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PGDP52209 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PGDP52209 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PGDP52209 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms