Protein–RNA interactions for Protein: P51795

CLCN5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN5P51795 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLCN5P51795 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLCN5P51795 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLCN5P51795 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLCN5P51795 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLCN5P51795 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLCN5P51795 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLCN5P51795 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLCN5P51795 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLCN5P51795 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLCN5P51795 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLCN5P51795 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLCN5P51795 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLCN5P51795 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLCN5P51795 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLCN5P51795 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CLCN5P51795 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CLCN5P51795 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLCN5P51795 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLCN5P51795 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLCN5P51795 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLCN5P51795 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLCN5P51795 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLCN5P51795 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLCN5P51795 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLCN5P51795 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLCN5P51795 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLCN5P51795 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CLCN5P51795 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLCN5P51795 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLCN5P51795 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLCN5P51795 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLCN5P51795 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLCN5P51795 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLCN5P51795 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLCN5P51795 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLCN5P51795 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLCN5P51795 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLCN5P51795 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLCN5P51795 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLCN5P51795 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLCN5P51795 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLCN5P51795 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLCN5P51795 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLCN5P51795 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLCN5P51795 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CLCN5P51795 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLCN5P51795 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLCN5P51795 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLCN5P51795 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CLCN5P51795 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLCN5P51795 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CLCN5P51795 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLCN5P51795 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLCN5P51795 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLCN5P51795 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLCN5P51795 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLCN5P51795 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLCN5P51795 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLCN5P51795 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLCN5P51795 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CLCN5P51795 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLCN5P51795 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLCN5P51795 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLCN5P51795 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLCN5P51795 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLCN5P51795 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLCN5P51795 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLCN5P51795 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLCN5P51795 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLCN5P51795 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLCN5P51795 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLCN5P51795 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLCN5P51795 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLCN5P51795 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLCN5P51795 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLCN5P51795 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CLCN5P51795 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLCN5P51795 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLCN5P51795 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLCN5P51795 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLCN5P51795 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLCN5P51795 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLCN5P51795 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLCN5P51795 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLCN5P51795 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLCN5P51795 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CLCN5P51795 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLCN5P51795 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLCN5P51795 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLCN5P51795 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLCN5P51795 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CLCN5P51795 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLCN5P51795 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLCN5P51795 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLCN5P51795 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CLCN5P51795 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CLCN5P51795 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLCN5P51795 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLCN5P51795 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms