Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CSRP3P50461 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CSRP3P50461 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSRP3P50461 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSRP3P50461 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSRP3P50461 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSRP3P50461 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSRP3P50461 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CSRP3P50461 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CSRP3P50461 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CSRP3P50461 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CSRP3P50461 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CSRP3P50461 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CSRP3P50461 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CSRP3P50461 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CSRP3P50461 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CSRP3P50461 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CSRP3P50461 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CSRP3P50461 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSRP3P50461 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSRP3P50461 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSRP3P50461 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSRP3P50461 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSRP3P50461 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSRP3P50461 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CSRP3P50461 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CSRP3P50461 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSRP3P50461 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSRP3P50461 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CSRP3P50461 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CSRP3P50461 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CSRP3P50461 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CSRP3P50461 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CSRP3P50461 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CSRP3P50461 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CSRP3P50461 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CSRP3P50461 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CSRP3P50461 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CSRP3P50461 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CSRP3P50461 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CSRP3P50461 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CSRP3P50461 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CSRP3P50461 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CSRP3P50461 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CSRP3P50461 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSRP3P50461 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSRP3P50461 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CSRP3P50461 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CSRP3P50461 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CSRP3P50461 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSRP3P50461 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSRP3P50461 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSRP3P50461 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSRP3P50461 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CSRP3P50461 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSRP3P50461 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSRP3P50461 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSRP3P50461 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSRP3P50461 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSRP3P50461 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSRP3P50461 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSRP3P50461 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSRP3P50461 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSRP3P50461 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSRP3P50461 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSRP3P50461 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSRP3P50461 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSRP3P50461 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CSRP3P50461 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSRP3P50461 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSRP3P50461 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSRP3P50461 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CSRP3P50461 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSRP3P50461 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSRP3P50461 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CSRP3P50461 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CSRP3P50461 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CSRP3P50461 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CSRP3P50461 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CSRP3P50461 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CSRP3P50461 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSRP3P50461 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSRP3P50461 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSRP3P50461 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSRP3P50461 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSRP3P50461 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSRP3P50461 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSRP3P50461 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CSRP3P50461 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSRP3P50461 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CSRP3P50461 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CSRP3P50461 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CSRP3P50461 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CSRP3P50461 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CSRP3P50461 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CSRP3P50461 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CSRP3P50461 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CSRP3P50461 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CSRP3P50461 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CSRP3P50461 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.2 ms