Protein–RNA interactions for Protein: P49238

CX3CR1, CX3C chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CX3CR1P49238 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CX3CR1P49238 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CX3CR1P49238 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CX3CR1P49238 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CX3CR1P49238 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CX3CR1P49238 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CX3CR1P49238 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CX3CR1P49238 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CX3CR1P49238 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CX3CR1P49238 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CX3CR1P49238 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CX3CR1P49238 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CX3CR1P49238 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CX3CR1P49238 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CX3CR1P49238 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CX3CR1P49238 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CX3CR1P49238 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CX3CR1P49238 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CX3CR1P49238 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CX3CR1P49238 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CX3CR1P49238 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CX3CR1P49238 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CX3CR1P49238 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CX3CR1P49238 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CX3CR1P49238 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CX3CR1P49238 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CX3CR1P49238 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CX3CR1P49238 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CX3CR1P49238 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CX3CR1P49238 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CX3CR1P49238 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CX3CR1P49238 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CX3CR1P49238 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CX3CR1P49238 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CX3CR1P49238 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CX3CR1P49238 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CX3CR1P49238 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CX3CR1P49238 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CX3CR1P49238 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CX3CR1P49238 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CX3CR1P49238 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CX3CR1P49238 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CX3CR1P49238 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CX3CR1P49238 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CX3CR1P49238 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CX3CR1P49238 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CX3CR1P49238 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CX3CR1P49238 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CX3CR1P49238 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CX3CR1P49238 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CX3CR1P49238 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CX3CR1P49238 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CX3CR1P49238 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CX3CR1P49238 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CX3CR1P49238 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CX3CR1P49238 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CX3CR1P49238 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CX3CR1P49238 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CX3CR1P49238 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CX3CR1P49238 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CX3CR1P49238 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CX3CR1P49238 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CX3CR1P49238 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CX3CR1P49238 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CX3CR1P49238 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CX3CR1P49238 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CX3CR1P49238 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CX3CR1P49238 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CX3CR1P49238 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CX3CR1P49238 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CX3CR1P49238 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CX3CR1P49238 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CX3CR1P49238 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CX3CR1P49238 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CX3CR1P49238 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CX3CR1P49238 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CX3CR1P49238 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CX3CR1P49238 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CX3CR1P49238 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CX3CR1P49238 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CX3CR1P49238 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CX3CR1P49238 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CX3CR1P49238 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CX3CR1P49238 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CX3CR1P49238 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CX3CR1P49238 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CX3CR1P49238 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CX3CR1P49238 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CX3CR1P49238 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CX3CR1P49238 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CX3CR1P49238 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CX3CR1P49238 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CX3CR1P49238 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CX3CR1P49238 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CX3CR1P49238 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CX3CR1P49238 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CX3CR1P49238 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CX3CR1P49238 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CX3CR1P49238 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CX3CR1P49238 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms