Protein–RNA interactions for Protein: P49005

POLD2, DNA polymerase delta subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD2P49005 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLD2P49005 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLD2P49005 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLD2P49005 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLD2P49005 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLD2P49005 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLD2P49005 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLD2P49005 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLD2P49005 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLD2P49005 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLD2P49005 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLD2P49005 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLD2P49005 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLD2P49005 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLD2P49005 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLD2P49005 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLD2P49005 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLD2P49005 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLD2P49005 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLD2P49005 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
POLD2P49005 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLD2P49005 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLD2P49005 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLD2P49005 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLD2P49005 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLD2P49005 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLD2P49005 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLD2P49005 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLD2P49005 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLD2P49005 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLD2P49005 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.96
POLD2P49005 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLD2P49005 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLD2P49005 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
POLD2P49005 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
POLD2P49005 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLD2P49005 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLD2P49005 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLD2P49005 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLD2P49005 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLD2P49005 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLD2P49005 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLD2P49005 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLD2P49005 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLD2P49005 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLD2P49005 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLD2P49005 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLD2P49005 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLD2P49005 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLD2P49005 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLD2P49005 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLD2P49005 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLD2P49005 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
POLD2P49005 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLD2P49005 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLD2P49005 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLD2P49005 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLD2P49005 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLD2P49005 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLD2P49005 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLD2P49005 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLD2P49005 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLD2P49005 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLD2P49005 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLD2P49005 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLD2P49005 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLD2P49005 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLD2P49005 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLD2P49005 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLD2P49005 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLD2P49005 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLD2P49005 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLD2P49005 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLD2P49005 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLD2P49005 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLD2P49005 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
POLD2P49005 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLD2P49005 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLD2P49005 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLD2P49005 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLD2P49005 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLD2P49005 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLD2P49005 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLD2P49005 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLD2P49005 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLD2P49005 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLD2P49005 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLD2P49005 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
POLD2P49005 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLD2P49005 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLD2P49005 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLD2P49005 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLD2P49005 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLD2P49005 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLD2P49005 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
POLD2P49005 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLD2P49005 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLD2P49005 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLD2P49005 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLD2P49005 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms