Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRATP43155 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRATP43155 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRATP43155 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRATP43155 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRATP43155 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CRATP43155 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRATP43155 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRATP43155 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRATP43155 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRATP43155 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRATP43155 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRATP43155 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRATP43155 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRATP43155 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRATP43155 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRATP43155 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRATP43155 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRATP43155 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRATP43155 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRATP43155 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRATP43155 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CRATP43155 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRATP43155 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRATP43155 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRATP43155 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRATP43155 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRATP43155 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRATP43155 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRATP43155 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRATP43155 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRATP43155 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRATP43155 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRATP43155 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRATP43155 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRATP43155 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRATP43155 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRATP43155 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRATP43155 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRATP43155 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CRATP43155 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRATP43155 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRATP43155 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRATP43155 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRATP43155 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRATP43155 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRATP43155 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRATP43155 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRATP43155 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRATP43155 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRATP43155 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CRATP43155 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRATP43155 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRATP43155 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRATP43155 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRATP43155 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRATP43155 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRATP43155 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRATP43155 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRATP43155 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRATP43155 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRATP43155 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRATP43155 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRATP43155 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRATP43155 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRATP43155 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRATP43155 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRATP43155 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRATP43155 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRATP43155 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRATP43155 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRATP43155 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRATP43155 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRATP43155 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CRATP43155 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CRATP43155 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRATP43155 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRATP43155 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRATP43155 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRATP43155 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRATP43155 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRATP43155 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRATP43155 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRATP43155 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRATP43155 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRATP43155 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRATP43155 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRATP43155 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRATP43155 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRATP43155 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CRATP43155 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CRATP43155 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CRATP43155 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRATP43155 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CRATP43155 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRATP43155 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRATP43155 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRATP43155 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRATP43155 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRATP43155 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms