Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CASP2P42575 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CASP2P42575 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CASP2P42575 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CASP2P42575 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CASP2P42575 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CASP2P42575 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CASP2P42575 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CASP2P42575 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CASP2P42575 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CASP2P42575 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CASP2P42575 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CASP2P42575 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CASP2P42575 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CASP2P42575 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CASP2P42575 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CASP2P42575 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CASP2P42575 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CASP2P42575 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CASP2P42575 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CASP2P42575 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CASP2P42575 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CASP2P42575 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CASP2P42575 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CASP2P42575 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CASP2P42575 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CASP2P42575 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CASP2P42575 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CASP2P42575 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CASP2P42575 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CASP2P42575 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CASP2P42575 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CASP2P42575 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CASP2P42575 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CASP2P42575 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CASP2P42575 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CASP2P42575 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CASP2P42575 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CASP2P42575 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CASP2P42575 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CASP2P42575 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CASP2P42575 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CASP2P42575 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CASP2P42575 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CASP2P42575 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CASP2P42575 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CASP2P42575 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CASP2P42575 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CASP2P42575 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CASP2P42575 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CASP2P42575 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CASP2P42575 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CASP2P42575 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CASP2P42575 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CASP2P42575 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CASP2P42575 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASP2P42575 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CASP2P42575 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASP2P42575 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASP2P42575 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASP2P42575 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASP2P42575 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASP2P42575 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASP2P42575 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CASP2P42575 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CASP2P42575 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CASP2P42575 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CASP2P42575 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CASP2P42575 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASP2P42575 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASP2P42575 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASP2P42575 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CASP2P42575 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASP2P42575 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASP2P42575 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASP2P42575 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASP2P42575 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASP2P42575 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASP2P42575 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASP2P42575 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASP2P42575 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CASP2P42575 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASP2P42575 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CASP2P42575 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CASP2P42575 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASP2P42575 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASP2P42575 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASP2P42575 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASP2P42575 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASP2P42575 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASP2P42575 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASP2P42575 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CASP2P42575 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CASP2P42575 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CASP2P42575 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CASP2P42575 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CASP2P42575 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CASP2P42575 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CASP2P42575 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CASP2P42575 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms