Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CASP2P42575 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CASP2P42575 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CASP2P42575 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
CASP2P42575 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
CASP2P42575 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CASP2P42575 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CASP2P42575 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CASP2P42575 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CASP2P42575 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CASP2P42575 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CASP2P42575 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CASP2P42575 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CASP2P42575 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CASP2P42575 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CASP2P42575 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CASP2P42575 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CASP2P42575 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CASP2P42575 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CASP2P42575 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CASP2P42575 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CASP2P42575 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CASP2P42575 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CASP2P42575 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CASP2P42575 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CASP2P42575 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CASP2P42575 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CASP2P42575 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CASP2P42575 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CASP2P42575 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CASP2P42575 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CASP2P42575 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CASP2P42575 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CASP2P42575 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CASP2P42575 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CASP2P42575 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CASP2P42575 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CASP2P42575 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CASP2P42575 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CASP2P42575 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CASP2P42575 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CASP2P42575 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CASP2P42575 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CASP2P42575 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CASP2P42575 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CASP2P42575 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CASP2P42575 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CASP2P42575 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CASP2P42575 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CASP2P42575 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CASP2P42575 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CASP2P42575 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CASP2P42575 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CASP2P42575 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CASP2P42575 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CASP2P42575 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CASP2P42575 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CASP2P42575 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CASP2P42575 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CASP2P42575 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CASP2P42575 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CASP2P42575 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CASP2P42575 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CASP2P42575 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CASP2P42575 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CASP2P42575 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CASP2P42575 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CASP2P42575 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CASP2P42575 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CASP2P42575 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CASP2P42575 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CASP2P42575 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CASP2P42575 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CASP2P42575 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CASP2P42575 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CASP2P42575 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CASP2P42575 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CASP2P42575 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CASP2P42575 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CASP2P42575 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
CASP2P42575 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CASP2P42575 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CASP2P42575 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CASP2P42575 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CASP2P42575 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CASP2P42575 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CASP2P42575 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CASP2P42575 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CASP2P42575 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CASP2P42575 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CASP2P42575 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CASP2P42575 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CASP2P42575 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CASP2P42575 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CASP2P42575 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CASP2P42575 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CASP2P42575 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CASP2P42575 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CASP2P42575 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CASP2P42575 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms