Protein–RNA interactions for Protein: P36873

PPP1CC, Serine/threonine-protein phosphatase PP1-gamma catalytic subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CCP36873 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP1CCP36873 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP1CCP36873 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP1CCP36873 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP1CCP36873 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP1CCP36873 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP1CCP36873 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP1CCP36873 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP1CCP36873 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1CCP36873 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1CCP36873 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP1CCP36873 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP1CCP36873 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1CCP36873 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1CCP36873 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1CCP36873 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1CCP36873 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1CCP36873 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1CCP36873 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PPP1CCP36873 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1CCP36873 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1CCP36873 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1CCP36873 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1CCP36873 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1CCP36873 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1CCP36873 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1CCP36873 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1CCP36873 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1CCP36873 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP1CCP36873 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP1CCP36873 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP1CCP36873 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP1CCP36873 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP1CCP36873 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1CCP36873 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1CCP36873 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1CCP36873 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1CCP36873 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1CCP36873 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1CCP36873 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1CCP36873 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1CCP36873 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1CCP36873 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP1CCP36873 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP1CCP36873 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPP1CCP36873 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP1CCP36873 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP1CCP36873 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP1CCP36873 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP1CCP36873 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP1CCP36873 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP1CCP36873 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP1CCP36873 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPP1CCP36873 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPP1CCP36873 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPP1CCP36873 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPP1CCP36873 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPP1CCP36873 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPP1CCP36873 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPP1CCP36873 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PPP1CCP36873 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPP1CCP36873 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPP1CCP36873 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPP1CCP36873 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPP1CCP36873 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP1CCP36873 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP1CCP36873 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP1CCP36873 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP1CCP36873 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP1CCP36873 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP1CCP36873 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1CCP36873 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1CCP36873 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1CCP36873 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1CCP36873 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1CCP36873 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PPP1CCP36873 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1CCP36873 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1CCP36873 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1CCP36873 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1CCP36873 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1CCP36873 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1CCP36873 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1CCP36873 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1CCP36873 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1CCP36873 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1CCP36873 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP1CCP36873 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1CCP36873 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1CCP36873 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP1CCP36873 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP1CCP36873 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP1CCP36873 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PPP1CCP36873 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP1CCP36873 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1CCP36873 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1CCP36873 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1CCP36873 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1CCP36873 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1CCP36873 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms