Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
FLT4P35916 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
FLT4P35916 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
FLT4P35916 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
FLT4P35916 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
FLT4P35916 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
FLT4P35916 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
FLT4P35916 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
FLT4P35916 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
FLT4P35916 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
FLT4P35916 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
FLT4P35916 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
FLT4P35916 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
FLT4P35916 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
FLT4P35916 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
FLT4P35916 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
FLT4P35916 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
FLT4P35916 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
FLT4P35916 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
FLT4P35916 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
FLT4P35916 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
FLT4P35916 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
FLT4P35916 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
FLT4P35916 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
FLT4P35916 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
FLT4P35916 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
FLT4P35916 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
FLT4P35916 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
FLT4P35916 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
FLT4P35916 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
FLT4P35916 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
FLT4P35916 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.43
FLT4P35916 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
FLT4P35916 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
FLT4P35916 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
FLT4P35916 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
FLT4P35916 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
FLT4P35916 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
FLT4P35916 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
FLT4P35916 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
FLT4P35916 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
FLT4P35916 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
FLT4P35916 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
FLT4P35916 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
FLT4P35916 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
FLT4P35916 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
FLT4P35916 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
FLT4P35916 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
FLT4P35916 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
FLT4P35916 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
FLT4P35916 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
FLT4P35916 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
FLT4P35916 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
FLT4P35916 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
FLT4P35916 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
FLT4P35916 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
FLT4P35916 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
FLT4P35916 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
FLT4P35916 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
FLT4P35916 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
FLT4P35916 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
FLT4P35916 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
FLT4P35916 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
FLT4P35916 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
FLT4P35916 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
FLT4P35916 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.41
FLT4P35916 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
FLT4P35916 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
FLT4P35916 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
FLT4P35916 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
FLT4P35916 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
FLT4P35916 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
FLT4P35916 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
FLT4P35916 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
FLT4P35916 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
FLT4P35916 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
FLT4P35916 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
FLT4P35916 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
FLT4P35916 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
FLT4P35916 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC36.26■■■■□ 3.39
FLT4P35916 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
FLT4P35916 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
FLT4P35916 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
FLT4P35916 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
FLT4P35916 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
FLT4P35916 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
FLT4P35916 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
FLT4P35916 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
FLT4P35916 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
FLT4P35916 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
FLT4P35916 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
FLT4P35916 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
FLT4P35916 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
FLT4P35916 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
FLT4P35916 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
FLT4P35916 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
FLT4P35916 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
FLT4P35916 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
FLT4P35916 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
FLT4P35916 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.5 ms