Protein–RNA interactions for Protein: P35790

CHKA, Choline kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKAP35790 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHKAP35790 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHKAP35790 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHKAP35790 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHKAP35790 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHKAP35790 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHKAP35790 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHKAP35790 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHKAP35790 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHKAP35790 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHKAP35790 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHKAP35790 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHKAP35790 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CHKAP35790 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHKAP35790 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHKAP35790 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHKAP35790 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHKAP35790 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CHKAP35790 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHKAP35790 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHKAP35790 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHKAP35790 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHKAP35790 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHKAP35790 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHKAP35790 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHKAP35790 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHKAP35790 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHKAP35790 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHKAP35790 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHKAP35790 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHKAP35790 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CHKAP35790 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHKAP35790 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHKAP35790 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHKAP35790 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHKAP35790 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHKAP35790 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHKAP35790 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHKAP35790 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHKAP35790 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHKAP35790 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHKAP35790 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHKAP35790 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHKAP35790 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHKAP35790 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHKAP35790 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHKAP35790 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHKAP35790 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHKAP35790 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHKAP35790 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHKAP35790 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHKAP35790 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHKAP35790 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHKAP35790 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHKAP35790 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHKAP35790 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHKAP35790 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHKAP35790 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHKAP35790 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHKAP35790 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHKAP35790 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CHKAP35790 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHKAP35790 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHKAP35790 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHKAP35790 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHKAP35790 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHKAP35790 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHKAP35790 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CHKAP35790 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHKAP35790 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHKAP35790 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHKAP35790 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHKAP35790 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHKAP35790 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHKAP35790 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CHKAP35790 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHKAP35790 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHKAP35790 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHKAP35790 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CHKAP35790 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CHKAP35790 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CHKAP35790 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHKAP35790 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHKAP35790 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHKAP35790 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHKAP35790 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHKAP35790 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHKAP35790 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHKAP35790 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHKAP35790 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CHKAP35790 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHKAP35790 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHKAP35790 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHKAP35790 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHKAP35790 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHKAP35790 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHKAP35790 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHKAP35790 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHKAP35790 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHKAP35790 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms