Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GBP1P32455 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GBP1P32455 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GBP1P32455 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GBP1P32455 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GBP1P32455 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GBP1P32455 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GBP1P32455 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
GBP1P32455 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GBP1P32455 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
GBP1P32455 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GBP1P32455 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GBP1P32455 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GBP1P32455 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GBP1P32455 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GBP1P32455 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GBP1P32455 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GBP1P32455 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GBP1P32455 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GBP1P32455 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GBP1P32455 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GBP1P32455 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GBP1P32455 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GBP1P32455 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GBP1P32455 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GBP1P32455 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GBP1P32455 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GBP1P32455 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GBP1P32455 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GBP1P32455 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GBP1P32455 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GBP1P32455 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GBP1P32455 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GBP1P32455 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
GBP1P32455 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GBP1P32455 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GBP1P32455 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GBP1P32455 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GBP1P32455 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GBP1P32455 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GBP1P32455 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
GBP1P32455 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GBP1P32455 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GBP1P32455 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GBP1P32455 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GBP1P32455 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GBP1P32455 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GBP1P32455 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GBP1P32455 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GBP1P32455 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GBP1P32455 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GBP1P32455 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GBP1P32455 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GBP1P32455 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GBP1P32455 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GBP1P32455 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GBP1P32455 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GBP1P32455 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
GBP1P32455 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GBP1P32455 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GBP1P32455 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GBP1P32455 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GBP1P32455 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GBP1P32455 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GBP1P32455 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GBP1P32455 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GBP1P32455 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GBP1P32455 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GBP1P32455 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
GBP1P32455 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
GBP1P32455 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GBP1P32455 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GBP1P32455 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GBP1P32455 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GBP1P32455 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GBP1P32455 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GBP1P32455 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GBP1P32455 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GBP1P32455 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GBP1P32455 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GBP1P32455 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GBP1P32455 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GBP1P32455 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
GBP1P32455 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GBP1P32455 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GBP1P32455 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GBP1P32455 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
GBP1P32455 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
GBP1P32455 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GBP1P32455 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GBP1P32455 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GBP1P32455 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GBP1P32455 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GBP1P32455 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
GBP1P32455 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
GBP1P32455 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GBP1P32455 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GBP1P32455 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GBP1P32455 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GBP1P32455 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.1 ms