Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRS3P32247 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRS3P32247 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRS3P32247 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRS3P32247 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRS3P32247 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BRS3P32247 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BRS3P32247 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRS3P32247 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRS3P32247 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRS3P32247 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRS3P32247 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRS3P32247 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRS3P32247 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRS3P32247 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRS3P32247 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRS3P32247 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRS3P32247 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRS3P32247 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRS3P32247 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRS3P32247 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRS3P32247 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRS3P32247 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRS3P32247 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRS3P32247 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRS3P32247 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRS3P32247 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRS3P32247 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRS3P32247 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRS3P32247 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRS3P32247 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BRS3P32247 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
BRS3P32247 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BRS3P32247 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRS3P32247 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BRS3P32247 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRS3P32247 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRS3P32247 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRS3P32247 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRS3P32247 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BRS3P32247 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BRS3P32247 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRS3P32247 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRS3P32247 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRS3P32247 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRS3P32247 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRS3P32247 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRS3P32247 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRS3P32247 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRS3P32247 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRS3P32247 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRS3P32247 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRS3P32247 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRS3P32247 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRS3P32247 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BRS3P32247 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRS3P32247 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRS3P32247 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRS3P32247 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRS3P32247 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRS3P32247 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRS3P32247 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRS3P32247 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRS3P32247 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRS3P32247 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRS3P32247 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRS3P32247 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRS3P32247 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRS3P32247 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRS3P32247 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRS3P32247 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRS3P32247 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRS3P32247 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRS3P32247 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRS3P32247 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRS3P32247 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRS3P32247 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRS3P32247 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRS3P32247 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRS3P32247 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRS3P32247 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRS3P32247 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRS3P32247 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRS3P32247 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRS3P32247 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRS3P32247 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRS3P32247 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRS3P32247 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRS3P32247 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BRS3P32247 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRS3P32247 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRS3P32247 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRS3P32247 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRS3P32247 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRS3P32247 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRS3P32247 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRS3P32247 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRS3P32247 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRS3P32247 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRS3P32247 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms