Protein–RNA interactions for Protein: P32242

OTX1, Homeobox protein OTX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX1P32242 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTX1P32242 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTX1P32242 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTX1P32242 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTX1P32242 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
OTX1P32242 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
OTX1P32242 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTX1P32242 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTX1P32242 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTX1P32242 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTX1P32242 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTX1P32242 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTX1P32242 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTX1P32242 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTX1P32242 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
OTX1P32242 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTX1P32242 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTX1P32242 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTX1P32242 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTX1P32242 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTX1P32242 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTX1P32242 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
OTX1P32242 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
OTX1P32242 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTX1P32242 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTX1P32242 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTX1P32242 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTX1P32242 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTX1P32242 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
OTX1P32242 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTX1P32242 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTX1P32242 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTX1P32242 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTX1P32242 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTX1P32242 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTX1P32242 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
OTX1P32242 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
OTX1P32242 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTX1P32242 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTX1P32242 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
OTX1P32242 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTX1P32242 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTX1P32242 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTX1P32242 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTX1P32242 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTX1P32242 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTX1P32242 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTX1P32242 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTX1P32242 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTX1P32242 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTX1P32242 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
OTX1P32242 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
OTX1P32242 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTX1P32242 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTX1P32242 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
OTX1P32242 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTX1P32242 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTX1P32242 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
OTX1P32242 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTX1P32242 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTX1P32242 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTX1P32242 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTX1P32242 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTX1P32242 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTX1P32242 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTX1P32242 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTX1P32242 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
OTX1P32242 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTX1P32242 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTX1P32242 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
OTX1P32242 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTX1P32242 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTX1P32242 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTX1P32242 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTX1P32242 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTX1P32242 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTX1P32242 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTX1P32242 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTX1P32242 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTX1P32242 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTX1P32242 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTX1P32242 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTX1P32242 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTX1P32242 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTX1P32242 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTX1P32242 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
OTX1P32242 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTX1P32242 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTX1P32242 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTX1P32242 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTX1P32242 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTX1P32242 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTX1P32242 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTX1P32242 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTX1P32242 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTX1P32242 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTX1P32242 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTX1P32242 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTX1P32242 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
OTX1P32242 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms