Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCKARP32238 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCKARP32238 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCKARP32238 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCKARP32238 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCKARP32238 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCKARP32238 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCKARP32238 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCKARP32238 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCKARP32238 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCKARP32238 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCKARP32238 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCKARP32238 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCKARP32238 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCKARP32238 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCKARP32238 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCKARP32238 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCKARP32238 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCKARP32238 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCKARP32238 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCKARP32238 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCKARP32238 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCKARP32238 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCKARP32238 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCKARP32238 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCKARP32238 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCKARP32238 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCKARP32238 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCKARP32238 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCKARP32238 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCKARP32238 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCKARP32238 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCKARP32238 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCKARP32238 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCKARP32238 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCKARP32238 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCKARP32238 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCKARP32238 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCKARP32238 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCKARP32238 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCKARP32238 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCKARP32238 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCKARP32238 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCKARP32238 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCKARP32238 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCKARP32238 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCKARP32238 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCKARP32238 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCKARP32238 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCKARP32238 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCKARP32238 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCKARP32238 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCKARP32238 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCKARP32238 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCKARP32238 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCKARP32238 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCKARP32238 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCKARP32238 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCKARP32238 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCKARP32238 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCKARP32238 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCKARP32238 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCKARP32238 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCKARP32238 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCKARP32238 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCKARP32238 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCKARP32238 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCKARP32238 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCKARP32238 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCKARP32238 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCKARP32238 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCKARP32238 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCKARP32238 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCKARP32238 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCKARP32238 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCKARP32238 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCKARP32238 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCKARP32238 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCKARP32238 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCKARP32238 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCKARP32238 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCKARP32238 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCKARP32238 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCKARP32238 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCKARP32238 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCKARP32238 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCKARP32238 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCKARP32238 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCKARP32238 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCKARP32238 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCKARP32238 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCKARP32238 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCKARP32238 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCKARP32238 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCKARP32238 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCKARP32238 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCKARP32238 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCKARP32238 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCKARP32238 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCKARP32238 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms