Protein–RNA interactions for Protein: P30876

POLR2B, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2BP30876 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
POLR2BP30876 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
POLR2BP30876 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
POLR2BP30876 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
POLR2BP30876 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
POLR2BP30876 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
POLR2BP30876 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
POLR2BP30876 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
POLR2BP30876 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
POLR2BP30876 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
POLR2BP30876 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
POLR2BP30876 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLR2BP30876 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLR2BP30876 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLR2BP30876 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLR2BP30876 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLR2BP30876 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
POLR2BP30876 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
POLR2BP30876 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
POLR2BP30876 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
POLR2BP30876 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
POLR2BP30876 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
POLR2BP30876 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
POLR2BP30876 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
POLR2BP30876 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
POLR2BP30876 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
POLR2BP30876 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
POLR2BP30876 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
POLR2BP30876 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
POLR2BP30876 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
POLR2BP30876 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
POLR2BP30876 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
POLR2BP30876 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
POLR2BP30876 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
POLR2BP30876 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
POLR2BP30876 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
POLR2BP30876 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
POLR2BP30876 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
POLR2BP30876 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
POLR2BP30876 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
POLR2BP30876 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
POLR2BP30876 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
POLR2BP30876 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
POLR2BP30876 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLR2BP30876 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
POLR2BP30876 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
POLR2BP30876 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
POLR2BP30876 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
POLR2BP30876 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
POLR2BP30876 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
POLR2BP30876 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
POLR2BP30876 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
POLR2BP30876 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
POLR2BP30876 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
POLR2BP30876 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
POLR2BP30876 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
POLR2BP30876 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
POLR2BP30876 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
POLR2BP30876 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
POLR2BP30876 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLR2BP30876 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLR2BP30876 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLR2BP30876 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLR2BP30876 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
POLR2BP30876 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLR2BP30876 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
POLR2BP30876 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
POLR2BP30876 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
POLR2BP30876 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
POLR2BP30876 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
POLR2BP30876 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLR2BP30876 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLR2BP30876 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLR2BP30876 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
POLR2BP30876 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
POLR2BP30876 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
POLR2BP30876 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
POLR2BP30876 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
POLR2BP30876 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
POLR2BP30876 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
POLR2BP30876 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
POLR2BP30876 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
POLR2BP30876 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
POLR2BP30876 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
POLR2BP30876 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLR2BP30876 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLR2BP30876 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLR2BP30876 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
POLR2BP30876 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLR2BP30876 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLR2BP30876 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLR2BP30876 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLR2BP30876 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLR2BP30876 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLR2BP30876 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
POLR2BP30876 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
POLR2BP30876 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
POLR2BP30876 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
POLR2BP30876 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
POLR2BP30876 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms