Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALDH4A1P30038 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ALDH4A1P30038 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALDH4A1P30038 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALDH4A1P30038 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALDH4A1P30038 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALDH4A1P30038 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALDH4A1P30038 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ALDH4A1P30038 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ALDH4A1P30038 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ALDH4A1P30038 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ALDH4A1P30038 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ALDH4A1P30038 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ALDH4A1P30038 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
ALDH4A1P30038 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALDH4A1P30038 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALDH4A1P30038 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALDH4A1P30038 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALDH4A1P30038 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ALDH4A1P30038 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALDH4A1P30038 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALDH4A1P30038 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALDH4A1P30038 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALDH4A1P30038 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALDH4A1P30038 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALDH4A1P30038 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ALDH4A1P30038 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ALDH4A1P30038 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ALDH4A1P30038 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ALDH4A1P30038 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ALDH4A1P30038 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALDH4A1P30038 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALDH4A1P30038 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ALDH4A1P30038 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ALDH4A1P30038 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ALDH4A1P30038 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALDH4A1P30038 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALDH4A1P30038 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALDH4A1P30038 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ALDH4A1P30038 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALDH4A1P30038 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALDH4A1P30038 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALDH4A1P30038 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ALDH4A1P30038 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALDH4A1P30038 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALDH4A1P30038 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALDH4A1P30038 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALDH4A1P30038 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALDH4A1P30038 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALDH4A1P30038 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALDH4A1P30038 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALDH4A1P30038 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ALDH4A1P30038 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ALDH4A1P30038 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ALDH4A1P30038 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ALDH4A1P30038 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ALDH4A1P30038 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ALDH4A1P30038 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ALDH4A1P30038 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ALDH4A1P30038 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ALDH4A1P30038 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALDH4A1P30038 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALDH4A1P30038 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALDH4A1P30038 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALDH4A1P30038 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALDH4A1P30038 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALDH4A1P30038 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ALDH4A1P30038 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ALDH4A1P30038 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ALDH4A1P30038 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ALDH4A1P30038 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALDH4A1P30038 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALDH4A1P30038 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALDH4A1P30038 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALDH4A1P30038 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ALDH4A1P30038 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ALDH4A1P30038 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ALDH4A1P30038 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ALDH4A1P30038 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ALDH4A1P30038 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ALDH4A1P30038 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ALDH4A1P30038 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ALDH4A1P30038 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ALDH4A1P30038 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ALDH4A1P30038 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALDH4A1P30038 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALDH4A1P30038 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALDH4A1P30038 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ALDH4A1P30038 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALDH4A1P30038 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALDH4A1P30038 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALDH4A1P30038 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALDH4A1P30038 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALDH4A1P30038 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALDH4A1P30038 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALDH4A1P30038 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ALDH4A1P30038 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ALDH4A1P30038 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ALDH4A1P30038 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALDH4A1P30038 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms