Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRABP1P29762 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRABP1P29762 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRABP1P29762 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRABP1P29762 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRABP1P29762 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRABP1P29762 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRABP1P29762 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRABP1P29762 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRABP1P29762 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRABP1P29762 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRABP1P29762 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRABP1P29762 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRABP1P29762 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRABP1P29762 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRABP1P29762 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRABP1P29762 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRABP1P29762 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRABP1P29762 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRABP1P29762 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRABP1P29762 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRABP1P29762 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRABP1P29762 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CRABP1P29762 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CRABP1P29762 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRABP1P29762 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRABP1P29762 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRABP1P29762 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRABP1P29762 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CRABP1P29762 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRABP1P29762 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRABP1P29762 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRABP1P29762 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRABP1P29762 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRABP1P29762 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRABP1P29762 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRABP1P29762 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRABP1P29762 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRABP1P29762 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRABP1P29762 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRABP1P29762 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRABP1P29762 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRABP1P29762 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRABP1P29762 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRABP1P29762 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CRABP1P29762 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CRABP1P29762 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRABP1P29762 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CRABP1P29762 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CRABP1P29762 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRABP1P29762 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRABP1P29762 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRABP1P29762 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRABP1P29762 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRABP1P29762 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRABP1P29762 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRABP1P29762 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRABP1P29762 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRABP1P29762 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRABP1P29762 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRABP1P29762 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRABP1P29762 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CRABP1P29762 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRABP1P29762 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CRABP1P29762 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CRABP1P29762 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CRABP1P29762 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CRABP1P29762 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CRABP1P29762 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CRABP1P29762 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CRABP1P29762 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CRABP1P29762 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRABP1P29762 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRABP1P29762 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRABP1P29762 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRABP1P29762 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRABP1P29762 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRABP1P29762 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRABP1P29762 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRABP1P29762 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRABP1P29762 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRABP1P29762 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRABP1P29762 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRABP1P29762 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRABP1P29762 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRABP1P29762 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRABP1P29762 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRABP1P29762 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRABP1P29762 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRABP1P29762 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRABP1P29762 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRABP1P29762 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRABP1P29762 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CRABP1P29762 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRABP1P29762 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRABP1P29762 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRABP1P29762 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRABP1P29762 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRABP1P29762 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRABP1P29762 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms