Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGA3P26006 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGA3P26006 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGA3P26006 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA3P26006 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA3P26006 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA3P26006 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA3P26006 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGA3P26006 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGA3P26006 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGA3P26006 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGA3P26006 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGA3P26006 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA3P26006 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA3P26006 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA3P26006 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA3P26006 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGA3P26006 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGA3P26006 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGA3P26006 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGA3P26006 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA3P26006 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA3P26006 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA3P26006 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA3P26006 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGA3P26006 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA3P26006 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGA3P26006 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ITGA3P26006 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGA3P26006 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGA3P26006 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGA3P26006 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGA3P26006 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA3P26006 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA3P26006 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA3P26006 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA3P26006 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA3P26006 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGA3P26006 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGA3P26006 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGA3P26006 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA3P26006 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA3P26006 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA3P26006 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA3P26006 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA3P26006 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA3P26006 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA3P26006 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA3P26006 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA3P26006 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGA3P26006 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGA3P26006 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ITGA3P26006 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ITGA3P26006 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGA3P26006 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGA3P26006 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGA3P26006 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGA3P26006 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGA3P26006 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGA3P26006 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGA3P26006 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGA3P26006 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGA3P26006 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGA3P26006 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGA3P26006 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGA3P26006 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGA3P26006 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGA3P26006 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGA3P26006 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGA3P26006 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGA3P26006 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGA3P26006 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGA3P26006 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGA3P26006 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGA3P26006 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITGA3P26006 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGA3P26006 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGA3P26006 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGA3P26006 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGA3P26006 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGA3P26006 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGA3P26006 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGA3P26006 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGA3P26006 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGA3P26006 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGA3P26006 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGA3P26006 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGA3P26006 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGA3P26006 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGA3P26006 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGA3P26006 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGA3P26006 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGA3P26006 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGA3P26006 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGA3P26006 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGA3P26006 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGA3P26006 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGA3P26006 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGA3P26006 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ITGA3P26006 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms