Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
ITGA3P26006 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
ITGA3P26006 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ITGA3P26006 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ITGA3P26006 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ITGA3P26006 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ITGA3P26006 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ITGA3P26006 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
ITGA3P26006 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ITGA3P26006 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ITGA3P26006 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ITGA3P26006 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ITGA3P26006 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ITGA3P26006 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ITGA3P26006 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ITGA3P26006 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ITGA3P26006 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
ITGA3P26006 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ITGA3P26006 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ITGA3P26006 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ITGA3P26006 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ITGA3P26006 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ITGA3P26006 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ITGA3P26006 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ITGA3P26006 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ITGA3P26006 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ITGA3P26006 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ITGA3P26006 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ITGA3P26006 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ITGA3P26006 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ITGA3P26006 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ITGA3P26006 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ITGA3P26006 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ITGA3P26006 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ITGA3P26006 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ITGA3P26006 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITGA3P26006 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGA3P26006 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ITGA3P26006 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ITGA3P26006 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ITGA3P26006 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGA3P26006 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITGA3P26006 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITGA3P26006 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ITGA3P26006 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ITGA3P26006 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGA3P26006 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ITGA3P26006 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGA3P26006 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGA3P26006 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ITGA3P26006 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGA3P26006 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ITGA3P26006 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGA3P26006 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGA3P26006 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGA3P26006 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGA3P26006 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ITGA3P26006 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITGA3P26006 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ITGA3P26006 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITGA3P26006 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGA3P26006 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGA3P26006 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGA3P26006 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGA3P26006 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ITGA3P26006 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ITGA3P26006 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ITGA3P26006 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ITGA3P26006 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGA3P26006 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
ITGA3P26006 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGA3P26006 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGA3P26006 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGA3P26006 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGA3P26006 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGA3P26006 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGA3P26006 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGA3P26006 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGA3P26006 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGA3P26006 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ITGA3P26006 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGA3P26006 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGA3P26006 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGA3P26006 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGA3P26006 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGA3P26006 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGA3P26006 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGA3P26006 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGA3P26006 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGA3P26006 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGA3P26006 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGA3P26006 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGA3P26006 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGA3P26006 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGA3P26006 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITGA3P26006 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGA3P26006 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGA3P26006 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGA3P26006 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGA3P26006 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms