Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTAFRP25105 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTAFRP25105 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTAFRP25105 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTAFRP25105 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PTAFRP25105 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTAFRP25105 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTAFRP25105 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTAFRP25105 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTAFRP25105 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PTAFRP25105 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTAFRP25105 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTAFRP25105 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTAFRP25105 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTAFRP25105 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTAFRP25105 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTAFRP25105 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTAFRP25105 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTAFRP25105 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTAFRP25105 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTAFRP25105 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PTAFRP25105 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTAFRP25105 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTAFRP25105 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTAFRP25105 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTAFRP25105 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTAFRP25105 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTAFRP25105 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTAFRP25105 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTAFRP25105 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTAFRP25105 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTAFRP25105 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PTAFRP25105 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PTAFRP25105 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTAFRP25105 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTAFRP25105 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTAFRP25105 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTAFRP25105 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PTAFRP25105 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTAFRP25105 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTAFRP25105 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTAFRP25105 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PTAFRP25105 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTAFRP25105 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTAFRP25105 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTAFRP25105 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTAFRP25105 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTAFRP25105 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTAFRP25105 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTAFRP25105 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTAFRP25105 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTAFRP25105 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTAFRP25105 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTAFRP25105 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTAFRP25105 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTAFRP25105 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTAFRP25105 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTAFRP25105 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTAFRP25105 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTAFRP25105 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTAFRP25105 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTAFRP25105 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTAFRP25105 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTAFRP25105 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTAFRP25105 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTAFRP25105 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTAFRP25105 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTAFRP25105 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTAFRP25105 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTAFRP25105 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTAFRP25105 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTAFRP25105 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTAFRP25105 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTAFRP25105 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTAFRP25105 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTAFRP25105 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTAFRP25105 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTAFRP25105 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTAFRP25105 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PTAFRP25105 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTAFRP25105 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTAFRP25105 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTAFRP25105 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTAFRP25105 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PTAFRP25105 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTAFRP25105 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTAFRP25105 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTAFRP25105 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTAFRP25105 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTAFRP25105 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTAFRP25105 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTAFRP25105 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTAFRP25105 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTAFRP25105 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTAFRP25105 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTAFRP25105 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTAFRP25105 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTAFRP25105 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTAFRP25105 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTAFRP25105 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms