Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFSF4P23510 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFSF4P23510 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFSF4P23510 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFSF4P23510 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFSF4P23510 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFSF4P23510 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFSF4P23510 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFSF4P23510 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFSF4P23510 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFSF4P23510 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFSF4P23510 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFSF4P23510 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFSF4P23510 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFSF4P23510 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFSF4P23510 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFSF4P23510 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFSF4P23510 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFSF4P23510 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFSF4P23510 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFSF4P23510 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFSF4P23510 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFSF4P23510 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF4P23510 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF4P23510 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFSF4P23510 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TNFSF4P23510 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFSF4P23510 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFSF4P23510 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFSF4P23510 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFSF4P23510 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFSF4P23510 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFSF4P23510 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFSF4P23510 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFSF4P23510 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFSF4P23510 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFSF4P23510 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFSF4P23510 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFSF4P23510 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFSF4P23510 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFSF4P23510 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFSF4P23510 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFSF4P23510 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFSF4P23510 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFSF4P23510 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFSF4P23510 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFSF4P23510 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFSF4P23510 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFSF4P23510 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFSF4P23510 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFSF4P23510 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFSF4P23510 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFSF4P23510 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFSF4P23510 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFSF4P23510 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFSF4P23510 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFSF4P23510 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFSF4P23510 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFSF4P23510 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFSF4P23510 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFSF4P23510 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFSF4P23510 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFSF4P23510 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFSF4P23510 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFSF4P23510 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFSF4P23510 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFSF4P23510 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFSF4P23510 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFSF4P23510 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFSF4P23510 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFSF4P23510 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFSF4P23510 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFSF4P23510 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFSF4P23510 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFSF4P23510 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFSF4P23510 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFSF4P23510 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFSF4P23510 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFSF4P23510 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF4P23510 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFSF4P23510 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFSF4P23510 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFSF4P23510 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFSF4P23510 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFSF4P23510 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFSF4P23510 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFSF4P23510 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFSF4P23510 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF4P23510 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF4P23510 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF4P23510 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFSF4P23510 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFSF4P23510 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFSF4P23510 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFSF4P23510 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFSF4P23510 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFSF4P23510 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFSF4P23510 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFSF4P23510 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFSF4P23510 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms