Protein–RNA interactions for Protein: P22090

RPS4Y1, 40S ribosomal protein S4, Y isoform 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4Y1P22090 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPS4Y1P22090 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPS4Y1P22090 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPS4Y1P22090 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPS4Y1P22090 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS4Y1P22090 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS4Y1P22090 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPS4Y1P22090 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RPS4Y1P22090 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPS4Y1P22090 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RPS4Y1P22090 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPS4Y1P22090 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS4Y1P22090 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS4Y1P22090 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPS4Y1P22090 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPS4Y1P22090 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPS4Y1P22090 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS4Y1P22090 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS4Y1P22090 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPS4Y1P22090 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPS4Y1P22090 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPS4Y1P22090 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPS4Y1P22090 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPS4Y1P22090 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS4Y1P22090 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS4Y1P22090 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPS4Y1P22090 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPS4Y1P22090 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPS4Y1P22090 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPS4Y1P22090 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS4Y1P22090 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RPS4Y1P22090 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS4Y1P22090 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS4Y1P22090 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPS4Y1P22090 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPS4Y1P22090 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPS4Y1P22090 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPS4Y1P22090 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPS4Y1P22090 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPS4Y1P22090 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS4Y1P22090 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPS4Y1P22090 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPS4Y1P22090 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPS4Y1P22090 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPS4Y1P22090 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RPS4Y1P22090 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS4Y1P22090 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPS4Y1P22090 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPS4Y1P22090 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RPS4Y1P22090 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPS4Y1P22090 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPS4Y1P22090 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPS4Y1P22090 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPS4Y1P22090 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPS4Y1P22090 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPS4Y1P22090 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPS4Y1P22090 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPS4Y1P22090 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPS4Y1P22090 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPS4Y1P22090 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPS4Y1P22090 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPS4Y1P22090 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPS4Y1P22090 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPS4Y1P22090 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RPS4Y1P22090 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPS4Y1P22090 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPS4Y1P22090 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPS4Y1P22090 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPS4Y1P22090 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPS4Y1P22090 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPS4Y1P22090 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPS4Y1P22090 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPS4Y1P22090 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPS4Y1P22090 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPS4Y1P22090 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPS4Y1P22090 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPS4Y1P22090 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPS4Y1P22090 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RPS4Y1P22090 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPS4Y1P22090 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPS4Y1P22090 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPS4Y1P22090 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RPS4Y1P22090 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
RPS4Y1P22090 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPS4Y1P22090 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPS4Y1P22090 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPS4Y1P22090 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPS4Y1P22090 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPS4Y1P22090 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPS4Y1P22090 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPS4Y1P22090 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPS4Y1P22090 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPS4Y1P22090 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS4Y1P22090 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPS4Y1P22090 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPS4Y1P22090 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
RPS4Y1P22090 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RPS4Y1P22090 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RPS4Y1P22090 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS4Y1P22090 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms