Protein–RNA interactions for Protein: P19484

TFEB, Transcription factor EB, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFEBP19484 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TFEBP19484 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TFEBP19484 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TFEBP19484 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TFEBP19484 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TFEBP19484 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TFEBP19484 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TFEBP19484 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TFEBP19484 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TFEBP19484 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TFEBP19484 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TFEBP19484 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TFEBP19484 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
TFEBP19484 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TFEBP19484 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TFEBP19484 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TFEBP19484 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TFEBP19484 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TFEBP19484 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TFEBP19484 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TFEBP19484 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TFEBP19484 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TFEBP19484 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TFEBP19484 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TFEBP19484 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TFEBP19484 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TFEBP19484 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TFEBP19484 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TFEBP19484 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TFEBP19484 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TFEBP19484 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TFEBP19484 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TFEBP19484 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TFEBP19484 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TFEBP19484 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TFEBP19484 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TFEBP19484 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TFEBP19484 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TFEBP19484 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
TFEBP19484 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TFEBP19484 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TFEBP19484 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TFEBP19484 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TFEBP19484 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TFEBP19484 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TFEBP19484 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TFEBP19484 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TFEBP19484 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TFEBP19484 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TFEBP19484 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TFEBP19484 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TFEBP19484 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TFEBP19484 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TFEBP19484 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TFEBP19484 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TFEBP19484 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TFEBP19484 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TFEBP19484 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TFEBP19484 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TFEBP19484 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TFEBP19484 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TFEBP19484 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TFEBP19484 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TFEBP19484 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TFEBP19484 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TFEBP19484 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TFEBP19484 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TFEBP19484 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TFEBP19484 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TFEBP19484 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TFEBP19484 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TFEBP19484 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TFEBP19484 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TFEBP19484 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TFEBP19484 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TFEBP19484 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TFEBP19484 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TFEBP19484 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TFEBP19484 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TFEBP19484 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TFEBP19484 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TFEBP19484 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TFEBP19484 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TFEBP19484 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TFEBP19484 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TFEBP19484 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TFEBP19484 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TFEBP19484 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TFEBP19484 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TFEBP19484 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TFEBP19484 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TFEBP19484 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TFEBP19484 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TFEBP19484 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TFEBP19484 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TFEBP19484 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TFEBP19484 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TFEBP19484 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TFEBP19484 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TFEBP19484 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 428 ms