Protein–RNA interactions for Protein: P17707

AMD1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMD1P17707 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AMD1P17707 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AMD1P17707 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AMD1P17707 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
AMD1P17707 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AMD1P17707 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AMD1P17707 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AMD1P17707 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
AMD1P17707 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
AMD1P17707 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
AMD1P17707 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AMD1P17707 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AMD1P17707 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AMD1P17707 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
AMD1P17707 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AMD1P17707 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
AMD1P17707 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AMD1P17707 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AMD1P17707 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
AMD1P17707 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
AMD1P17707 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
AMD1P17707 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
AMD1P17707 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AMD1P17707 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
AMD1P17707 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
AMD1P17707 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
AMD1P17707 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
AMD1P17707 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AMD1P17707 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
AMD1P17707 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AMD1P17707 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AMD1P17707 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
AMD1P17707 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AMD1P17707 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AMD1P17707 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AMD1P17707 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
AMD1P17707 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AMD1P17707 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AMD1P17707 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
AMD1P17707 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
AMD1P17707 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
AMD1P17707 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AMD1P17707 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AMD1P17707 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
AMD1P17707 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AMD1P17707 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
AMD1P17707 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
AMD1P17707 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
AMD1P17707 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
AMD1P17707 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
AMD1P17707 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
AMD1P17707 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
AMD1P17707 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
AMD1P17707 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AMD1P17707 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
AMD1P17707 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
AMD1P17707 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
AMD1P17707 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AMD1P17707 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AMD1P17707 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
AMD1P17707 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
AMD1P17707 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
AMD1P17707 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
AMD1P17707 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AMD1P17707 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AMD1P17707 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AMD1P17707 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
AMD1P17707 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AMD1P17707 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AMD1P17707 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
AMD1P17707 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AMD1P17707 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
AMD1P17707 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
AMD1P17707 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
AMD1P17707 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
AMD1P17707 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
AMD1P17707 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AMD1P17707 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AMD1P17707 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AMD1P17707 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
AMD1P17707 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AMD1P17707 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
AMD1P17707 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
AMD1P17707 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AMD1P17707 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AMD1P17707 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AMD1P17707 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AMD1P17707 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
AMD1P17707 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
AMD1P17707 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
AMD1P17707 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AMD1P17707 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AMD1P17707 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
AMD1P17707 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
AMD1P17707 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AMD1P17707 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AMD1P17707 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AMD1P17707 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AMD1P17707 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AMD1P17707 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms